Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX63

CHCHD3, MICOS complex subunit MIC19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD3Q9NX63 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms