Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWA0

MED9, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED9Q9NWA0 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MED9Q9NWA0 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MED9Q9NWA0 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MED9Q9NWA0 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MED9Q9NWA0 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MED9Q9NWA0 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MED9Q9NWA0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MED9Q9NWA0 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MED9Q9NWA0 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MED9Q9NWA0 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MED9Q9NWA0 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MED9Q9NWA0 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MED9Q9NWA0 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MED9Q9NWA0 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MED9Q9NWA0 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MED9Q9NWA0 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MED9Q9NWA0 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MED9Q9NWA0 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MED9Q9NWA0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MED9Q9NWA0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MED9Q9NWA0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MED9Q9NWA0 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MED9Q9NWA0 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MED9Q9NWA0 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MED9Q9NWA0 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MED9Q9NWA0 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MED9Q9NWA0 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MED9Q9NWA0 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MED9Q9NWA0 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MED9Q9NWA0 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MED9Q9NWA0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MED9Q9NWA0 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MED9Q9NWA0 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MED9Q9NWA0 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MED9Q9NWA0 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MED9Q9NWA0 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MED9Q9NWA0 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MED9Q9NWA0 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MED9Q9NWA0 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MED9Q9NWA0 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MED9Q9NWA0 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MED9Q9NWA0 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MED9Q9NWA0 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MED9Q9NWA0 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MED9Q9NWA0 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MED9Q9NWA0 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MED9Q9NWA0 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MED9Q9NWA0 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MED9Q9NWA0 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MED9Q9NWA0 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MED9Q9NWA0 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MED9Q9NWA0 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MED9Q9NWA0 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MED9Q9NWA0 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MED9Q9NWA0 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
MED9Q9NWA0 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MED9Q9NWA0 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MED9Q9NWA0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MED9Q9NWA0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MED9Q9NWA0 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MED9Q9NWA0 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MED9Q9NWA0 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MED9Q9NWA0 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MED9Q9NWA0 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MED9Q9NWA0 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MED9Q9NWA0 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MED9Q9NWA0 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MED9Q9NWA0 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MED9Q9NWA0 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MED9Q9NWA0 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MED9Q9NWA0 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MED9Q9NWA0 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MED9Q9NWA0 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MED9Q9NWA0 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
MED9Q9NWA0 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MED9Q9NWA0 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MED9Q9NWA0 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MED9Q9NWA0 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MED9Q9NWA0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MED9Q9NWA0 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MED9Q9NWA0 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MED9Q9NWA0 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MED9Q9NWA0 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MED9Q9NWA0 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MED9Q9NWA0 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MED9Q9NWA0 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MED9Q9NWA0 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MED9Q9NWA0 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MED9Q9NWA0 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MED9Q9NWA0 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MED9Q9NWA0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MED9Q9NWA0 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MED9Q9NWA0 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MED9Q9NWA0 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MED9Q9NWA0 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MED9Q9NWA0 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MED9Q9NWA0 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MED9Q9NWA0 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MED9Q9NWA0 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MED9Q9NWA0 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms