Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVF7

FBXO28, F-box only protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO28Q9NVF7 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO28Q9NVF7 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO28Q9NVF7 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO28Q9NVF7 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO28Q9NVF7 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO28Q9NVF7 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO28Q9NVF7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO28Q9NVF7 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO28Q9NVF7 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO28Q9NVF7 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO28Q9NVF7 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO28Q9NVF7 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO28Q9NVF7 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO28Q9NVF7 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO28Q9NVF7 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO28Q9NVF7 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO28Q9NVF7 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO28Q9NVF7 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO28Q9NVF7 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO28Q9NVF7 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO28Q9NVF7 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO28Q9NVF7 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO28Q9NVF7 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO28Q9NVF7 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
FBXO28Q9NVF7 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO28Q9NVF7 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO28Q9NVF7 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO28Q9NVF7 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO28Q9NVF7 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO28Q9NVF7 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO28Q9NVF7 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO28Q9NVF7 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO28Q9NVF7 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO28Q9NVF7 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO28Q9NVF7 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO28Q9NVF7 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO28Q9NVF7 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO28Q9NVF7 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO28Q9NVF7 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO28Q9NVF7 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO28Q9NVF7 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO28Q9NVF7 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO28Q9NVF7 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO28Q9NVF7 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO28Q9NVF7 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO28Q9NVF7 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO28Q9NVF7 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO28Q9NVF7 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO28Q9NVF7 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXO28Q9NVF7 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXO28Q9NVF7 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXO28Q9NVF7 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXO28Q9NVF7 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXO28Q9NVF7 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXO28Q9NVF7 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXO28Q9NVF7 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXO28Q9NVF7 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXO28Q9NVF7 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXO28Q9NVF7 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXO28Q9NVF7 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXO28Q9NVF7 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO28Q9NVF7 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO28Q9NVF7 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO28Q9NVF7 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO28Q9NVF7 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO28Q9NVF7 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO28Q9NVF7 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO28Q9NVF7 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO28Q9NVF7 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO28Q9NVF7 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO28Q9NVF7 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO28Q9NVF7 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO28Q9NVF7 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO28Q9NVF7 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO28Q9NVF7 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO28Q9NVF7 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO28Q9NVF7 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO28Q9NVF7 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO28Q9NVF7 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO28Q9NVF7 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO28Q9NVF7 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO28Q9NVF7 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO28Q9NVF7 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO28Q9NVF7 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO28Q9NVF7 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO28Q9NVF7 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO28Q9NVF7 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO28Q9NVF7 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXO28Q9NVF7 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXO28Q9NVF7 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXO28Q9NVF7 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXO28Q9NVF7 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXO28Q9NVF7 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXO28Q9NVF7 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXO28Q9NVF7 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXO28Q9NVF7 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXO28Q9NVF7 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXO28Q9NVF7 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXO28Q9NVF7 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXO28Q9NVF7 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms