Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVE4

CCDC87, Coiled-coil domain-containing protein 87, humanhuman

Predictions only

Length 849 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC87Q9NVE4 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC87Q9NVE4 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC87Q9NVE4 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC87Q9NVE4 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC87Q9NVE4 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC87Q9NVE4 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC87Q9NVE4 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC87Q9NVE4 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC87Q9NVE4 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC87Q9NVE4 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC87Q9NVE4 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC87Q9NVE4 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC87Q9NVE4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC87Q9NVE4 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC87Q9NVE4 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC87Q9NVE4 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC87Q9NVE4 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC87Q9NVE4 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC87Q9NVE4 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC87Q9NVE4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC87Q9NVE4 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC87Q9NVE4 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC87Q9NVE4 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC87Q9NVE4 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC87Q9NVE4 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC87Q9NVE4 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC87Q9NVE4 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC87Q9NVE4 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC87Q9NVE4 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC87Q9NVE4 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC87Q9NVE4 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC87Q9NVE4 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC87Q9NVE4 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC87Q9NVE4 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC87Q9NVE4 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC87Q9NVE4 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC87Q9NVE4 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC87Q9NVE4 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC87Q9NVE4 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC87Q9NVE4 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC87Q9NVE4 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC87Q9NVE4 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC87Q9NVE4 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC87Q9NVE4 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC87Q9NVE4 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC87Q9NVE4 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC87Q9NVE4 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC87Q9NVE4 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC87Q9NVE4 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC87Q9NVE4 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC87Q9NVE4 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC87Q9NVE4 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC87Q9NVE4 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC87Q9NVE4 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC87Q9NVE4 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC87Q9NVE4 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC87Q9NVE4 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC87Q9NVE4 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC87Q9NVE4 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC87Q9NVE4 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC87Q9NVE4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC87Q9NVE4 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC87Q9NVE4 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC87Q9NVE4 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC87Q9NVE4 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC87Q9NVE4 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC87Q9NVE4 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC87Q9NVE4 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC87Q9NVE4 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC87Q9NVE4 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC87Q9NVE4 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC87Q9NVE4 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC87Q9NVE4 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC87Q9NVE4 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC87Q9NVE4 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC87Q9NVE4 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC87Q9NVE4 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC87Q9NVE4 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC87Q9NVE4 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC87Q9NVE4 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC87Q9NVE4 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC87Q9NVE4 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC87Q9NVE4 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC87Q9NVE4 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC87Q9NVE4 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC87Q9NVE4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC87Q9NVE4 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC87Q9NVE4 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC87Q9NVE4 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC87Q9NVE4 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC87Q9NVE4 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC87Q9NVE4 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC87Q9NVE4 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC87Q9NVE4 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC87Q9NVE4 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC87Q9NVE4 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC87Q9NVE4 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC87Q9NVE4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC87Q9NVE4 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC87Q9NVE4 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms