Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTJ3

SMC4, Structural maintenance of chromosomes protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC4Q9NTJ3 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMC4Q9NTJ3 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMC4Q9NTJ3 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMC4Q9NTJ3 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMC4Q9NTJ3 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SMC4Q9NTJ3 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMC4Q9NTJ3 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMC4Q9NTJ3 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMC4Q9NTJ3 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SMC4Q9NTJ3 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMC4Q9NTJ3 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMC4Q9NTJ3 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMC4Q9NTJ3 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SMC4Q9NTJ3 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMC4Q9NTJ3 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMC4Q9NTJ3 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMC4Q9NTJ3 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMC4Q9NTJ3 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMC4Q9NTJ3 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMC4Q9NTJ3 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMC4Q9NTJ3 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMC4Q9NTJ3 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMC4Q9NTJ3 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMC4Q9NTJ3 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMC4Q9NTJ3 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMC4Q9NTJ3 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMC4Q9NTJ3 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMC4Q9NTJ3 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMC4Q9NTJ3 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMC4Q9NTJ3 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMC4Q9NTJ3 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMC4Q9NTJ3 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMC4Q9NTJ3 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMC4Q9NTJ3 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMC4Q9NTJ3 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMC4Q9NTJ3 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SMC4Q9NTJ3 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMC4Q9NTJ3 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SMC4Q9NTJ3 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMC4Q9NTJ3 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMC4Q9NTJ3 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMC4Q9NTJ3 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SMC4Q9NTJ3 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMC4Q9NTJ3 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMC4Q9NTJ3 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMC4Q9NTJ3 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMC4Q9NTJ3 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMC4Q9NTJ3 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMC4Q9NTJ3 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMC4Q9NTJ3 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.6
SMC4Q9NTJ3 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMC4Q9NTJ3 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMC4Q9NTJ3 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMC4Q9NTJ3 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMC4Q9NTJ3 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMC4Q9NTJ3 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMC4Q9NTJ3 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMC4Q9NTJ3 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMC4Q9NTJ3 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMC4Q9NTJ3 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMC4Q9NTJ3 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMC4Q9NTJ3 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMC4Q9NTJ3 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMC4Q9NTJ3 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMC4Q9NTJ3 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMC4Q9NTJ3 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMC4Q9NTJ3 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMC4Q9NTJ3 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMC4Q9NTJ3 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMC4Q9NTJ3 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SMC4Q9NTJ3 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SMC4Q9NTJ3 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMC4Q9NTJ3 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMC4Q9NTJ3 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMC4Q9NTJ3 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMC4Q9NTJ3 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SMC4Q9NTJ3 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SMC4Q9NTJ3 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SMC4Q9NTJ3 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SMC4Q9NTJ3 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SMC4Q9NTJ3 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SMC4Q9NTJ3 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMC4Q9NTJ3 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
SMC4Q9NTJ3 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SMC4Q9NTJ3 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SMC4Q9NTJ3 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMC4Q9NTJ3 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMC4Q9NTJ3 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMC4Q9NTJ3 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMC4Q9NTJ3 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMC4Q9NTJ3 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SMC4Q9NTJ3 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMC4Q9NTJ3 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SMC4Q9NTJ3 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMC4Q9NTJ3 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SMC4Q9NTJ3 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SMC4Q9NTJ3 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMC4Q9NTJ3 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMC4Q9NTJ3 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMC4Q9NTJ3 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms