Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS61

KCNIP2, Kv channel-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP2Q9NS61 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms