Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS56

TOPORS, E3 ubiquitin-protein ligase Topors, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,045 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPORSQ9NS56 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TOPORSQ9NS56 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TOPORSQ9NS56 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TOPORSQ9NS56 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TOPORSQ9NS56 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TOPORSQ9NS56 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TOPORSQ9NS56 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TOPORSQ9NS56 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TOPORSQ9NS56 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TOPORSQ9NS56 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TOPORSQ9NS56 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TOPORSQ9NS56 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TOPORSQ9NS56 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TOPORSQ9NS56 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TOPORSQ9NS56 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TOPORSQ9NS56 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TOPORSQ9NS56 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TOPORSQ9NS56 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TOPORSQ9NS56 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TOPORSQ9NS56 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TOPORSQ9NS56 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TOPORSQ9NS56 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TOPORSQ9NS56 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TOPORSQ9NS56 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TOPORSQ9NS56 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TOPORSQ9NS56 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TOPORSQ9NS56 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TOPORSQ9NS56 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TOPORSQ9NS56 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TOPORSQ9NS56 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TOPORSQ9NS56 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TOPORSQ9NS56 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TOPORSQ9NS56 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TOPORSQ9NS56 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TOPORSQ9NS56 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TOPORSQ9NS56 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
TOPORSQ9NS56 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TOPORSQ9NS56 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TOPORSQ9NS56 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TOPORSQ9NS56 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TOPORSQ9NS56 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TOPORSQ9NS56 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TOPORSQ9NS56 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TOPORSQ9NS56 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TOPORSQ9NS56 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TOPORSQ9NS56 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TOPORSQ9NS56 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TOPORSQ9NS56 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TOPORSQ9NS56 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TOPORSQ9NS56 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TOPORSQ9NS56 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TOPORSQ9NS56 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TOPORSQ9NS56 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TOPORSQ9NS56 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TOPORSQ9NS56 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TOPORSQ9NS56 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TOPORSQ9NS56 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TOPORSQ9NS56 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TOPORSQ9NS56 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TOPORSQ9NS56 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TOPORSQ9NS56 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TOPORSQ9NS56 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TOPORSQ9NS56 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TOPORSQ9NS56 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TOPORSQ9NS56 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TOPORSQ9NS56 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TOPORSQ9NS56 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TOPORSQ9NS56 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TOPORSQ9NS56 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TOPORSQ9NS56 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TOPORSQ9NS56 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TOPORSQ9NS56 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TOPORSQ9NS56 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TOPORSQ9NS56 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TOPORSQ9NS56 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TOPORSQ9NS56 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TOPORSQ9NS56 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TOPORSQ9NS56 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TOPORSQ9NS56 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TOPORSQ9NS56 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TOPORSQ9NS56 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TOPORSQ9NS56 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TOPORSQ9NS56 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
TOPORSQ9NS56 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TOPORSQ9NS56 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TOPORSQ9NS56 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TOPORSQ9NS56 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TOPORSQ9NS56 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TOPORSQ9NS56 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TOPORSQ9NS56 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TOPORSQ9NS56 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TOPORSQ9NS56 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TOPORSQ9NS56 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TOPORSQ9NS56 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TOPORSQ9NS56 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TOPORSQ9NS56 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TOPORSQ9NS56 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TOPORSQ9NS56 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TOPORSQ9NS56 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TOPORSQ9NS56 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms