Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ5

PAPOLB, Poly(A) polymerase beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPOLBQ9NRJ5 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms