Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHST12Q9NRB3 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHST12Q9NRB3 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHST12Q9NRB3 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHST12Q9NRB3 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHST12Q9NRB3 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHST12Q9NRB3 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHST12Q9NRB3 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHST12Q9NRB3 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHST12Q9NRB3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHST12Q9NRB3 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHST12Q9NRB3 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHST12Q9NRB3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHST12Q9NRB3 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHST12Q9NRB3 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHST12Q9NRB3 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHST12Q9NRB3 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHST12Q9NRB3 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CHST12Q9NRB3 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHST12Q9NRB3 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHST12Q9NRB3 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHST12Q9NRB3 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHST12Q9NRB3 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHST12Q9NRB3 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHST12Q9NRB3 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHST12Q9NRB3 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHST12Q9NRB3 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHST12Q9NRB3 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHST12Q9NRB3 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHST12Q9NRB3 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CHST12Q9NRB3 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CHST12Q9NRB3 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CHST12Q9NRB3 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CHST12Q9NRB3 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHST12Q9NRB3 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHST12Q9NRB3 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHST12Q9NRB3 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHST12Q9NRB3 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHST12Q9NRB3 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHST12Q9NRB3 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHST12Q9NRB3 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHST12Q9NRB3 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHST12Q9NRB3 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHST12Q9NRB3 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHST12Q9NRB3 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHST12Q9NRB3 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CHST12Q9NRB3 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CHST12Q9NRB3 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHST12Q9NRB3 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHST12Q9NRB3 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHST12Q9NRB3 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHST12Q9NRB3 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHST12Q9NRB3 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHST12Q9NRB3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHST12Q9NRB3 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHST12Q9NRB3 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHST12Q9NRB3 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHST12Q9NRB3 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHST12Q9NRB3 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHST12Q9NRB3 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHST12Q9NRB3 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHST12Q9NRB3 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHST12Q9NRB3 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHST12Q9NRB3 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CHST12Q9NRB3 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHST12Q9NRB3 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHST12Q9NRB3 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CHST12Q9NRB3 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHST12Q9NRB3 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHST12Q9NRB3 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHST12Q9NRB3 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHST12Q9NRB3 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHST12Q9NRB3 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHST12Q9NRB3 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHST12Q9NRB3 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHST12Q9NRB3 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHST12Q9NRB3 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHST12Q9NRB3 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CHST12Q9NRB3 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CHST12Q9NRB3 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHST12Q9NRB3 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHST12Q9NRB3 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHST12Q9NRB3 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHST12Q9NRB3 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CHST12Q9NRB3 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHST12Q9NRB3 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHST12Q9NRB3 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHST12Q9NRB3 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHST12Q9NRB3 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHST12Q9NRB3 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHST12Q9NRB3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHST12Q9NRB3 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHST12Q9NRB3 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHST12Q9NRB3 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHST12Q9NRB3 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHST12Q9NRB3 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHST12Q9NRB3 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHST12Q9NRB3 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHST12Q9NRB3 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHST12Q9NRB3 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms