Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP90

RAB9B, Ras-related protein Rab-9B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9BQ9NP90 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB9BQ9NP90 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms