Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZCCHC17Q9NP64 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZCCHC17Q9NP64 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ZCCHC17Q9NP64 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZCCHC17Q9NP64 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ZCCHC17Q9NP64 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZCCHC17Q9NP64 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ZCCHC17Q9NP64 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZCCHC17Q9NP64 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZCCHC17Q9NP64 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZCCHC17Q9NP64 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZCCHC17Q9NP64 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZCCHC17Q9NP64 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZCCHC17Q9NP64 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZCCHC17Q9NP64 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZCCHC17Q9NP64 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZCCHC17Q9NP64 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZCCHC17Q9NP64 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZCCHC17Q9NP64 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZCCHC17Q9NP64 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZCCHC17Q9NP64 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZCCHC17Q9NP64 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZCCHC17Q9NP64 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZCCHC17Q9NP64 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZCCHC17Q9NP64 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZCCHC17Q9NP64 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZCCHC17Q9NP64 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZCCHC17Q9NP64 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZCCHC17Q9NP64 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZCCHC17Q9NP64 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZCCHC17Q9NP64 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZCCHC17Q9NP64 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZCCHC17Q9NP64 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZCCHC17Q9NP64 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZCCHC17Q9NP64 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZCCHC17Q9NP64 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZCCHC17Q9NP64 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZCCHC17Q9NP64 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ZCCHC17Q9NP64 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ZCCHC17Q9NP64 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZCCHC17Q9NP64 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZCCHC17Q9NP64 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZCCHC17Q9NP64 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZCCHC17Q9NP64 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZCCHC17Q9NP64 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZCCHC17Q9NP64 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZCCHC17Q9NP64 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZCCHC17Q9NP64 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZCCHC17Q9NP64 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ZCCHC17Q9NP64 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZCCHC17Q9NP64 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZCCHC17Q9NP64 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZCCHC17Q9NP64 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZCCHC17Q9NP64 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZCCHC17Q9NP64 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZCCHC17Q9NP64 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ZCCHC17Q9NP64 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZCCHC17Q9NP64 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZCCHC17Q9NP64 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZCCHC17Q9NP64 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ZCCHC17Q9NP64 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZCCHC17Q9NP64 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ZCCHC17Q9NP64 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZCCHC17Q9NP64 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZCCHC17Q9NP64 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZCCHC17Q9NP64 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZCCHC17Q9NP64 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZCCHC17Q9NP64 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZCCHC17Q9NP64 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZCCHC17Q9NP64 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZCCHC17Q9NP64 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZCCHC17Q9NP64 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ZCCHC17Q9NP64 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZCCHC17Q9NP64 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ZCCHC17Q9NP64 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZCCHC17Q9NP64 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZCCHC17Q9NP64 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZCCHC17Q9NP64 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ZCCHC17Q9NP64 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZCCHC17Q9NP64 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZCCHC17Q9NP64 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZCCHC17Q9NP64 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZCCHC17Q9NP64 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZCCHC17Q9NP64 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZCCHC17Q9NP64 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZCCHC17Q9NP64 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZCCHC17Q9NP64 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZCCHC17Q9NP64 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZCCHC17Q9NP64 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZCCHC17Q9NP64 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZCCHC17Q9NP64 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZCCHC17Q9NP64 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZCCHC17Q9NP64 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ZCCHC17Q9NP64 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZCCHC17Q9NP64 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZCCHC17Q9NP64 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZCCHC17Q9NP64 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZCCHC17Q9NP64 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZCCHC17Q9NP64 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZCCHC17Q9NP64 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms