Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBX8

LGR6, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 6, humanhuman

Predictions only

Length 967 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGR6Q9HBX8 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LGR6Q9HBX8 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LGR6Q9HBX8 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LGR6Q9HBX8 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LGR6Q9HBX8 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LGR6Q9HBX8 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LGR6Q9HBX8 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LGR6Q9HBX8 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LGR6Q9HBX8 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LGR6Q9HBX8 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LGR6Q9HBX8 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LGR6Q9HBX8 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LGR6Q9HBX8 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
LGR6Q9HBX8 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LGR6Q9HBX8 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LGR6Q9HBX8 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LGR6Q9HBX8 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LGR6Q9HBX8 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LGR6Q9HBX8 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LGR6Q9HBX8 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LGR6Q9HBX8 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LGR6Q9HBX8 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LGR6Q9HBX8 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LGR6Q9HBX8 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LGR6Q9HBX8 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LGR6Q9HBX8 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
LGR6Q9HBX8 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
LGR6Q9HBX8 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
LGR6Q9HBX8 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LGR6Q9HBX8 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LGR6Q9HBX8 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LGR6Q9HBX8 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LGR6Q9HBX8 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LGR6Q9HBX8 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LGR6Q9HBX8 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LGR6Q9HBX8 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LGR6Q9HBX8 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LGR6Q9HBX8 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LGR6Q9HBX8 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LGR6Q9HBX8 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LGR6Q9HBX8 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LGR6Q9HBX8 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LGR6Q9HBX8 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LGR6Q9HBX8 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LGR6Q9HBX8 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LGR6Q9HBX8 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LGR6Q9HBX8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LGR6Q9HBX8 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LGR6Q9HBX8 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LGR6Q9HBX8 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LGR6Q9HBX8 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
LGR6Q9HBX8 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LGR6Q9HBX8 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LGR6Q9HBX8 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LGR6Q9HBX8 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LGR6Q9HBX8 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LGR6Q9HBX8 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LGR6Q9HBX8 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LGR6Q9HBX8 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LGR6Q9HBX8 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LGR6Q9HBX8 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LGR6Q9HBX8 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LGR6Q9HBX8 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LGR6Q9HBX8 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LGR6Q9HBX8 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LGR6Q9HBX8 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LGR6Q9HBX8 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LGR6Q9HBX8 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LGR6Q9HBX8 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LGR6Q9HBX8 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LGR6Q9HBX8 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LGR6Q9HBX8 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LGR6Q9HBX8 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LGR6Q9HBX8 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
LGR6Q9HBX8 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LGR6Q9HBX8 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
LGR6Q9HBX8 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LGR6Q9HBX8 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LGR6Q9HBX8 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LGR6Q9HBX8 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LGR6Q9HBX8 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LGR6Q9HBX8 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LGR6Q9HBX8 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LGR6Q9HBX8 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LGR6Q9HBX8 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LGR6Q9HBX8 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
LGR6Q9HBX8 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
LGR6Q9HBX8 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
LGR6Q9HBX8 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LGR6Q9HBX8 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LGR6Q9HBX8 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LGR6Q9HBX8 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LGR6Q9HBX8 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LGR6Q9HBX8 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LGR6Q9HBX8 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LGR6Q9HBX8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LGR6Q9HBX8 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LGR6Q9HBX8 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LGR6Q9HBX8 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LGR6Q9HBX8 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms