Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6U6

BCAS3, Breast carcinoma-amplified sequence 3, humanhuman

Predictions only

Length 928 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAS3Q9H6U6 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BCAS3Q9H6U6 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BCAS3Q9H6U6 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BCAS3Q9H6U6 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BCAS3Q9H6U6 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BCAS3Q9H6U6 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BCAS3Q9H6U6 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BCAS3Q9H6U6 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BCAS3Q9H6U6 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BCAS3Q9H6U6 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BCAS3Q9H6U6 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BCAS3Q9H6U6 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BCAS3Q9H6U6 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BCAS3Q9H6U6 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BCAS3Q9H6U6 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
BCAS3Q9H6U6 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BCAS3Q9H6U6 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BCAS3Q9H6U6 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BCAS3Q9H6U6 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BCAS3Q9H6U6 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
BCAS3Q9H6U6 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BCAS3Q9H6U6 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BCAS3Q9H6U6 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BCAS3Q9H6U6 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BCAS3Q9H6U6 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BCAS3Q9H6U6 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BCAS3Q9H6U6 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BCAS3Q9H6U6 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BCAS3Q9H6U6 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BCAS3Q9H6U6 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BCAS3Q9H6U6 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BCAS3Q9H6U6 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BCAS3Q9H6U6 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BCAS3Q9H6U6 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BCAS3Q9H6U6 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BCAS3Q9H6U6 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BCAS3Q9H6U6 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BCAS3Q9H6U6 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BCAS3Q9H6U6 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BCAS3Q9H6U6 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BCAS3Q9H6U6 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BCAS3Q9H6U6 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BCAS3Q9H6U6 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BCAS3Q9H6U6 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BCAS3Q9H6U6 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BCAS3Q9H6U6 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BCAS3Q9H6U6 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BCAS3Q9H6U6 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BCAS3Q9H6U6 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BCAS3Q9H6U6 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BCAS3Q9H6U6 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BCAS3Q9H6U6 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BCAS3Q9H6U6 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BCAS3Q9H6U6 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
BCAS3Q9H6U6 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BCAS3Q9H6U6 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BCAS3Q9H6U6 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BCAS3Q9H6U6 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BCAS3Q9H6U6 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BCAS3Q9H6U6 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BCAS3Q9H6U6 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BCAS3Q9H6U6 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
BCAS3Q9H6U6 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BCAS3Q9H6U6 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BCAS3Q9H6U6 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BCAS3Q9H6U6 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BCAS3Q9H6U6 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BCAS3Q9H6U6 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BCAS3Q9H6U6 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BCAS3Q9H6U6 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BCAS3Q9H6U6 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BCAS3Q9H6U6 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BCAS3Q9H6U6 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BCAS3Q9H6U6 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BCAS3Q9H6U6 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BCAS3Q9H6U6 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
BCAS3Q9H6U6 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BCAS3Q9H6U6 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BCAS3Q9H6U6 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BCAS3Q9H6U6 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BCAS3Q9H6U6 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BCAS3Q9H6U6 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BCAS3Q9H6U6 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BCAS3Q9H6U6 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BCAS3Q9H6U6 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
BCAS3Q9H6U6 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BCAS3Q9H6U6 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BCAS3Q9H6U6 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
BCAS3Q9H6U6 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BCAS3Q9H6U6 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BCAS3Q9H6U6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BCAS3Q9H6U6 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BCAS3Q9H6U6 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BCAS3Q9H6U6 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BCAS3Q9H6U6 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BCAS3Q9H6U6 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
BCAS3Q9H6U6 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BCAS3Q9H6U6 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BCAS3Q9H6U6 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
BCAS3Q9H6U6 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.1 ms