Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4Q4

PRDM12, PR domain zinc finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM12Q9H4Q4 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PRDM12Q9H4Q4 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRDM12Q9H4Q4 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRDM12Q9H4Q4 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRDM12Q9H4Q4 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRDM12Q9H4Q4 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRDM12Q9H4Q4 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRDM12Q9H4Q4 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRDM12Q9H4Q4 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRDM12Q9H4Q4 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRDM12Q9H4Q4 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRDM12Q9H4Q4 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRDM12Q9H4Q4 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRDM12Q9H4Q4 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRDM12Q9H4Q4 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRDM12Q9H4Q4 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRDM12Q9H4Q4 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRDM12Q9H4Q4 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRDM12Q9H4Q4 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRDM12Q9H4Q4 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRDM12Q9H4Q4 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRDM12Q9H4Q4 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRDM12Q9H4Q4 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRDM12Q9H4Q4 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRDM12Q9H4Q4 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRDM12Q9H4Q4 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRDM12Q9H4Q4 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRDM12Q9H4Q4 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRDM12Q9H4Q4 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRDM12Q9H4Q4 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRDM12Q9H4Q4 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRDM12Q9H4Q4 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRDM12Q9H4Q4 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRDM12Q9H4Q4 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRDM12Q9H4Q4 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRDM12Q9H4Q4 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRDM12Q9H4Q4 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRDM12Q9H4Q4 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRDM12Q9H4Q4 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRDM12Q9H4Q4 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRDM12Q9H4Q4 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRDM12Q9H4Q4 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRDM12Q9H4Q4 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRDM12Q9H4Q4 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRDM12Q9H4Q4 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PRDM12Q9H4Q4 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PRDM12Q9H4Q4 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PRDM12Q9H4Q4 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRDM12Q9H4Q4 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRDM12Q9H4Q4 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PRDM12Q9H4Q4 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRDM12Q9H4Q4 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRDM12Q9H4Q4 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRDM12Q9H4Q4 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRDM12Q9H4Q4 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRDM12Q9H4Q4 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRDM12Q9H4Q4 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRDM12Q9H4Q4 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRDM12Q9H4Q4 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRDM12Q9H4Q4 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRDM12Q9H4Q4 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PRDM12Q9H4Q4 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PRDM12Q9H4Q4 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRDM12Q9H4Q4 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PRDM12Q9H4Q4 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRDM12Q9H4Q4 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRDM12Q9H4Q4 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRDM12Q9H4Q4 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRDM12Q9H4Q4 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRDM12Q9H4Q4 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRDM12Q9H4Q4 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRDM12Q9H4Q4 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRDM12Q9H4Q4 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRDM12Q9H4Q4 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRDM12Q9H4Q4 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRDM12Q9H4Q4 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRDM12Q9H4Q4 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRDM12Q9H4Q4 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRDM12Q9H4Q4 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRDM12Q9H4Q4 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRDM12Q9H4Q4 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRDM12Q9H4Q4 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRDM12Q9H4Q4 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRDM12Q9H4Q4 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRDM12Q9H4Q4 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRDM12Q9H4Q4 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRDM12Q9H4Q4 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRDM12Q9H4Q4 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRDM12Q9H4Q4 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRDM12Q9H4Q4 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRDM12Q9H4Q4 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRDM12Q9H4Q4 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRDM12Q9H4Q4 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRDM12Q9H4Q4 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRDM12Q9H4Q4 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRDM12Q9H4Q4 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRDM12Q9H4Q4 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRDM12Q9H4Q4 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PRDM12Q9H4Q4 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PRDM12Q9H4Q4 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms