Protein–RNA interactions for Protein: Q9H1M0

NUP62CL, Nucleoporin-62 C-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP62CLQ9H1M0 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUP62CLQ9H1M0 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUP62CLQ9H1M0 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUP62CLQ9H1M0 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUP62CLQ9H1M0 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NUP62CLQ9H1M0 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUP62CLQ9H1M0 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUP62CLQ9H1M0 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUP62CLQ9H1M0 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUP62CLQ9H1M0 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUP62CLQ9H1M0 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUP62CLQ9H1M0 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUP62CLQ9H1M0 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUP62CLQ9H1M0 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUP62CLQ9H1M0 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUP62CLQ9H1M0 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NUP62CLQ9H1M0 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUP62CLQ9H1M0 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUP62CLQ9H1M0 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUP62CLQ9H1M0 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUP62CLQ9H1M0 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUP62CLQ9H1M0 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUP62CLQ9H1M0 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUP62CLQ9H1M0 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NUP62CLQ9H1M0 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUP62CLQ9H1M0 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUP62CLQ9H1M0 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUP62CLQ9H1M0 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUP62CLQ9H1M0 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUP62CLQ9H1M0 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUP62CLQ9H1M0 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUP62CLQ9H1M0 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUP62CLQ9H1M0 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUP62CLQ9H1M0 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUP62CLQ9H1M0 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUP62CLQ9H1M0 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUP62CLQ9H1M0 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUP62CLQ9H1M0 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUP62CLQ9H1M0 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUP62CLQ9H1M0 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUP62CLQ9H1M0 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUP62CLQ9H1M0 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUP62CLQ9H1M0 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUP62CLQ9H1M0 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUP62CLQ9H1M0 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUP62CLQ9H1M0 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUP62CLQ9H1M0 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUP62CLQ9H1M0 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUP62CLQ9H1M0 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUP62CLQ9H1M0 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUP62CLQ9H1M0 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUP62CLQ9H1M0 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUP62CLQ9H1M0 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUP62CLQ9H1M0 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUP62CLQ9H1M0 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUP62CLQ9H1M0 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUP62CLQ9H1M0 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUP62CLQ9H1M0 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUP62CLQ9H1M0 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUP62CLQ9H1M0 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUP62CLQ9H1M0 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUP62CLQ9H1M0 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUP62CLQ9H1M0 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUP62CLQ9H1M0 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUP62CLQ9H1M0 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUP62CLQ9H1M0 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUP62CLQ9H1M0 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUP62CLQ9H1M0 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUP62CLQ9H1M0 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUP62CLQ9H1M0 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUP62CLQ9H1M0 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUP62CLQ9H1M0 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUP62CLQ9H1M0 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUP62CLQ9H1M0 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUP62CLQ9H1M0 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUP62CLQ9H1M0 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUP62CLQ9H1M0 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUP62CLQ9H1M0 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NUP62CLQ9H1M0 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUP62CLQ9H1M0 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUP62CLQ9H1M0 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUP62CLQ9H1M0 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUP62CLQ9H1M0 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUP62CLQ9H1M0 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUP62CLQ9H1M0 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUP62CLQ9H1M0 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUP62CLQ9H1M0 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUP62CLQ9H1M0 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUP62CLQ9H1M0 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUP62CLQ9H1M0 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NUP62CLQ9H1M0 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUP62CLQ9H1M0 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUP62CLQ9H1M0 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUP62CLQ9H1M0 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUP62CLQ9H1M0 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUP62CLQ9H1M0 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUP62CLQ9H1M0 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUP62CLQ9H1M0 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUP62CLQ9H1M0 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUP62CLQ9H1M0 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms