Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W5

CCDC8, Coiled-coil domain-containing protein 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC8Q9H0W5 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC8Q9H0W5 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC8Q9H0W5 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC8Q9H0W5 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC8Q9H0W5 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC8Q9H0W5 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC8Q9H0W5 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC8Q9H0W5 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC8Q9H0W5 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC8Q9H0W5 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC8Q9H0W5 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC8Q9H0W5 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC8Q9H0W5 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC8Q9H0W5 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC8Q9H0W5 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC8Q9H0W5 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC8Q9H0W5 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC8Q9H0W5 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC8Q9H0W5 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC8Q9H0W5 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC8Q9H0W5 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC8Q9H0W5 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC8Q9H0W5 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC8Q9H0W5 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC8Q9H0W5 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC8Q9H0W5 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC8Q9H0W5 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC8Q9H0W5 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC8Q9H0W5 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC8Q9H0W5 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC8Q9H0W5 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC8Q9H0W5 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC8Q9H0W5 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC8Q9H0W5 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC8Q9H0W5 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC8Q9H0W5 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC8Q9H0W5 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC8Q9H0W5 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC8Q9H0W5 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC8Q9H0W5 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC8Q9H0W5 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC8Q9H0W5 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC8Q9H0W5 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC8Q9H0W5 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC8Q9H0W5 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC8Q9H0W5 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC8Q9H0W5 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC8Q9H0W5 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC8Q9H0W5 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC8Q9H0W5 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC8Q9H0W5 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC8Q9H0W5 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC8Q9H0W5 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC8Q9H0W5 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC8Q9H0W5 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC8Q9H0W5 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC8Q9H0W5 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC8Q9H0W5 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC8Q9H0W5 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC8Q9H0W5 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC8Q9H0W5 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC8Q9H0W5 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC8Q9H0W5 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC8Q9H0W5 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC8Q9H0W5 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC8Q9H0W5 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC8Q9H0W5 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC8Q9H0W5 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC8Q9H0W5 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC8Q9H0W5 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC8Q9H0W5 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC8Q9H0W5 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC8Q9H0W5 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC8Q9H0W5 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC8Q9H0W5 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC8Q9H0W5 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC8Q9H0W5 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC8Q9H0W5 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC8Q9H0W5 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC8Q9H0W5 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC8Q9H0W5 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC8Q9H0W5 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC8Q9H0W5 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC8Q9H0W5 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC8Q9H0W5 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC8Q9H0W5 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC8Q9H0W5 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC8Q9H0W5 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC8Q9H0W5 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC8Q9H0W5 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC8Q9H0W5 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC8Q9H0W5 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC8Q9H0W5 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC8Q9H0W5 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC8Q9H0W5 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC8Q9H0W5 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC8Q9H0W5 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC8Q9H0W5 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC8Q9H0W5 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC8Q9H0W5 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms