Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA4CQ9C0C4 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA4CQ9C0C4 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA4CQ9C0C4 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA4CQ9C0C4 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA4CQ9C0C4 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA4CQ9C0C4 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA4CQ9C0C4 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA4CQ9C0C4 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA4CQ9C0C4 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA4CQ9C0C4 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA4CQ9C0C4 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA4CQ9C0C4 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA4CQ9C0C4 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA4CQ9C0C4 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA4CQ9C0C4 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA4CQ9C0C4 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA4CQ9C0C4 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA4CQ9C0C4 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA4CQ9C0C4 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA4CQ9C0C4 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA4CQ9C0C4 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA4CQ9C0C4 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA4CQ9C0C4 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA4CQ9C0C4 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA4CQ9C0C4 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA4CQ9C0C4 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA4CQ9C0C4 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA4CQ9C0C4 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA4CQ9C0C4 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA4CQ9C0C4 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA4CQ9C0C4 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SEMA4CQ9C0C4 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SEMA4CQ9C0C4 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SEMA4CQ9C0C4 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA4CQ9C0C4 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA4CQ9C0C4 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA4CQ9C0C4 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA4CQ9C0C4 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA4CQ9C0C4 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA4CQ9C0C4 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA4CQ9C0C4 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA4CQ9C0C4 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA4CQ9C0C4 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA4CQ9C0C4 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA4CQ9C0C4 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA4CQ9C0C4 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA4CQ9C0C4 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA4CQ9C0C4 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA4CQ9C0C4 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA4CQ9C0C4 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA4CQ9C0C4 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA4CQ9C0C4 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA4CQ9C0C4 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA4CQ9C0C4 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA4CQ9C0C4 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA4CQ9C0C4 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA4CQ9C0C4 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA4CQ9C0C4 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA4CQ9C0C4 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA4CQ9C0C4 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA4CQ9C0C4 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA4CQ9C0C4 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA4CQ9C0C4 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA4CQ9C0C4 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA4CQ9C0C4 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA4CQ9C0C4 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA4CQ9C0C4 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA4CQ9C0C4 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA4CQ9C0C4 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA4CQ9C0C4 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA4CQ9C0C4 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA4CQ9C0C4 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA4CQ9C0C4 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA4CQ9C0C4 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA4CQ9C0C4 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA4CQ9C0C4 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA4CQ9C0C4 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA4CQ9C0C4 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA4CQ9C0C4 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA4CQ9C0C4 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA4CQ9C0C4 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA4CQ9C0C4 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA4CQ9C0C4 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA4CQ9C0C4 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA4CQ9C0C4 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA4CQ9C0C4 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA4CQ9C0C4 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA4CQ9C0C4 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA4CQ9C0C4 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA4CQ9C0C4 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA4CQ9C0C4 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA4CQ9C0C4 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA4CQ9C0C4 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA4CQ9C0C4 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA4CQ9C0C4 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA4CQ9C0C4 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA4CQ9C0C4 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA4CQ9C0C4 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA4CQ9C0C4 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms