Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NLRP1Q9C000 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NLRP1Q9C000 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NLRP1Q9C000 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NLRP1Q9C000 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
NLRP1Q9C000 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
NLRP1Q9C000 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NLRP1Q9C000 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NLRP1Q9C000 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
NLRP1Q9C000 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NLRP1Q9C000 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NLRP1Q9C000 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NLRP1Q9C000 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NLRP1Q9C000 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NLRP1Q9C000 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NLRP1Q9C000 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NLRP1Q9C000 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NLRP1Q9C000 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NLRP1Q9C000 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NLRP1Q9C000 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NLRP1Q9C000 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NLRP1Q9C000 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NLRP1Q9C000 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
NLRP1Q9C000 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NLRP1Q9C000 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NLRP1Q9C000 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NLRP1Q9C000 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NLRP1Q9C000 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NLRP1Q9C000 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
NLRP1Q9C000 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NLRP1Q9C000 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NLRP1Q9C000 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NLRP1Q9C000 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NLRP1Q9C000 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NLRP1Q9C000 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NLRP1Q9C000 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NLRP1Q9C000 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NLRP1Q9C000 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NLRP1Q9C000 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NLRP1Q9C000 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NLRP1Q9C000 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NLRP1Q9C000 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NLRP1Q9C000 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NLRP1Q9C000 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NLRP1Q9C000 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NLRP1Q9C000 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NLRP1Q9C000 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NLRP1Q9C000 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NLRP1Q9C000 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NLRP1Q9C000 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NLRP1Q9C000 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NLRP1Q9C000 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NLRP1Q9C000 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NLRP1Q9C000 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NLRP1Q9C000 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NLRP1Q9C000 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NLRP1Q9C000 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NLRP1Q9C000 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NLRP1Q9C000 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NLRP1Q9C000 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NLRP1Q9C000 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NLRP1Q9C000 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NLRP1Q9C000 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NLRP1Q9C000 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NLRP1Q9C000 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NLRP1Q9C000 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NLRP1Q9C000 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NLRP1Q9C000 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NLRP1Q9C000 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NLRP1Q9C000 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NLRP1Q9C000 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NLRP1Q9C000 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NLRP1Q9C000 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NLRP1Q9C000 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NLRP1Q9C000 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NLRP1Q9C000 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NLRP1Q9C000 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NLRP1Q9C000 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NLRP1Q9C000 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NLRP1Q9C000 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NLRP1Q9C000 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NLRP1Q9C000 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NLRP1Q9C000 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NLRP1Q9C000 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NLRP1Q9C000 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NLRP1Q9C000 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NLRP1Q9C000 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NLRP1Q9C000 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NLRP1Q9C000 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
NLRP1Q9C000 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NLRP1Q9C000 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
NLRP1Q9C000 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NLRP1Q9C000 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NLRP1Q9C000 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NLRP1Q9C000 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NLRP1Q9C000 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NLRP1Q9C000 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NLRP1Q9C000 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NLRP1Q9C000 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NLRP1Q9C000 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms