Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC8.94□□□□□ -0.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.94□□□□□ -0.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL158050.2-201ENST00000605336 568 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.94□□□□□ -0.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP003108.4-201ENST00000623917 878 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC8.94□□□□□ -0.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.94□□□□□ -0.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC8.94□□□□□ -0.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC8.93□□□□□ -0.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRMT13-201ENST00000370139 711 ntTSL 3 BASIC8.93□□□□□ -0.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.93□□□□□ -0.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC8.93□□□□□ -0.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 SCP2-205ENST00000408941 1298 ntTSL 2 BASIC8.93□□□□□ -0.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL513283.1-201ENST00000441790 1087 ntTSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC8.93□□□□□ -0.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC8.93□□□□□ -0.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC8.93□□□□□ -0.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC8.93□□□□□ -0.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC008764.5-201ENST00000597851 190 ntTSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.93□□□□□ -0.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC006213.5-201ENST00000619673 288 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC8.93□□□□□ -0.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.93□□□□□ -0.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC8.93□□□□□ -0.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC8.93□□□□□ -0.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.92□□□□□ -0.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC8.92□□□□□ -0.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC8.92□□□□□ -0.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC8.92□□□□□ -0.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC8.92□□□□□ -0.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC8.92□□□□□ -0.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC8.92□□□□□ -0.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 OR2X1P-201ENST00000421144 687 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms