Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG8

GSDMC, Gasdermin-C, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMCQ9BYG8 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GSDMCQ9BYG8 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GSDMCQ9BYG8 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GSDMCQ9BYG8 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
GSDMCQ9BYG8 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GSDMCQ9BYG8 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
GSDMCQ9BYG8 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GSDMCQ9BYG8 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GSDMCQ9BYG8 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GSDMCQ9BYG8 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GSDMCQ9BYG8 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
GSDMCQ9BYG8 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GSDMCQ9BYG8 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GSDMCQ9BYG8 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GSDMCQ9BYG8 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GSDMCQ9BYG8 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GSDMCQ9BYG8 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GSDMCQ9BYG8 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GSDMCQ9BYG8 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GSDMCQ9BYG8 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GSDMCQ9BYG8 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GSDMCQ9BYG8 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GSDMCQ9BYG8 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GSDMCQ9BYG8 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GSDMCQ9BYG8 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GSDMCQ9BYG8 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GSDMCQ9BYG8 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GSDMCQ9BYG8 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GSDMCQ9BYG8 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GSDMCQ9BYG8 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GSDMCQ9BYG8 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GSDMCQ9BYG8 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GSDMCQ9BYG8 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GSDMCQ9BYG8 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GSDMCQ9BYG8 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GSDMCQ9BYG8 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GSDMCQ9BYG8 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GSDMCQ9BYG8 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GSDMCQ9BYG8 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GSDMCQ9BYG8 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GSDMCQ9BYG8 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms