Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY65

NPCDR1, Nasopharyngeal carcinoma down-regulated gene protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPCDR1Q9BY65 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms