Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL7

CARD11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARD11Q9BXL7 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CARD11Q9BXL7 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CARD11Q9BXL7 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CARD11Q9BXL7 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CARD11Q9BXL7 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CARD11Q9BXL7 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CARD11Q9BXL7 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CARD11Q9BXL7 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CARD11Q9BXL7 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CARD11Q9BXL7 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CARD11Q9BXL7 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CARD11Q9BXL7 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CARD11Q9BXL7 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CARD11Q9BXL7 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CARD11Q9BXL7 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CARD11Q9BXL7 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CARD11Q9BXL7 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CARD11Q9BXL7 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CARD11Q9BXL7 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CARD11Q9BXL7 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CARD11Q9BXL7 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CARD11Q9BXL7 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CARD11Q9BXL7 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CARD11Q9BXL7 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CARD11Q9BXL7 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CARD11Q9BXL7 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CARD11Q9BXL7 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CARD11Q9BXL7 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CARD11Q9BXL7 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CARD11Q9BXL7 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CARD11Q9BXL7 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CARD11Q9BXL7 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CARD11Q9BXL7 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CARD11Q9BXL7 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CARD11Q9BXL7 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CARD11Q9BXL7 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CARD11Q9BXL7 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CARD11Q9BXL7 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CARD11Q9BXL7 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CARD11Q9BXL7 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CARD11Q9BXL7 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CARD11Q9BXL7 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CARD11Q9BXL7 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CARD11Q9BXL7 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CARD11Q9BXL7 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CARD11Q9BXL7 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CARD11Q9BXL7 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CARD11Q9BXL7 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CARD11Q9BXL7 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CARD11Q9BXL7 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CARD11Q9BXL7 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CARD11Q9BXL7 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CARD11Q9BXL7 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CARD11Q9BXL7 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CARD11Q9BXL7 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CARD11Q9BXL7 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CARD11Q9BXL7 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CARD11Q9BXL7 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CARD11Q9BXL7 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CARD11Q9BXL7 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CARD11Q9BXL7 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CARD11Q9BXL7 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CARD11Q9BXL7 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CARD11Q9BXL7 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CARD11Q9BXL7 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CARD11Q9BXL7 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CARD11Q9BXL7 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CARD11Q9BXL7 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CARD11Q9BXL7 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CARD11Q9BXL7 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CARD11Q9BXL7 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CARD11Q9BXL7 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CARD11Q9BXL7 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CARD11Q9BXL7 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CARD11Q9BXL7 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CARD11Q9BXL7 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CARD11Q9BXL7 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CARD11Q9BXL7 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CARD11Q9BXL7 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CARD11Q9BXL7 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CARD11Q9BXL7 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CARD11Q9BXL7 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CARD11Q9BXL7 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CARD11Q9BXL7 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CARD11Q9BXL7 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CARD11Q9BXL7 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CARD11Q9BXL7 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CARD11Q9BXL7 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CARD11Q9BXL7 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CARD11Q9BXL7 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CARD11Q9BXL7 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CARD11Q9BXL7 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CARD11Q9BXL7 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CARD11Q9BXL7 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CARD11Q9BXL7 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CARD11Q9BXL7 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CARD11Q9BXL7 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CARD11Q9BXL7 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CARD11Q9BXL7 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CARD11Q9BXL7 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms