Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRIP1Q9BX63 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRIP1Q9BX63 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRIP1Q9BX63 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRIP1Q9BX63 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRIP1Q9BX63 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRIP1Q9BX63 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRIP1Q9BX63 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRIP1Q9BX63 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
BRIP1Q9BX63 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRIP1Q9BX63 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRIP1Q9BX63 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRIP1Q9BX63 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRIP1Q9BX63 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRIP1Q9BX63 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRIP1Q9BX63 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRIP1Q9BX63 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRIP1Q9BX63 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
BRIP1Q9BX63 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRIP1Q9BX63 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRIP1Q9BX63 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRIP1Q9BX63 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRIP1Q9BX63 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRIP1Q9BX63 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRIP1Q9BX63 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRIP1Q9BX63 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRIP1Q9BX63 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRIP1Q9BX63 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRIP1Q9BX63 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRIP1Q9BX63 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRIP1Q9BX63 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRIP1Q9BX63 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRIP1Q9BX63 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRIP1Q9BX63 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRIP1Q9BX63 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRIP1Q9BX63 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRIP1Q9BX63 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRIP1Q9BX63 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRIP1Q9BX63 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
BRIP1Q9BX63 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
BRIP1Q9BX63 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
BRIP1Q9BX63 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
BRIP1Q9BX63 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRIP1Q9BX63 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRIP1Q9BX63 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRIP1Q9BX63 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRIP1Q9BX63 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRIP1Q9BX63 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRIP1Q9BX63 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRIP1Q9BX63 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRIP1Q9BX63 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRIP1Q9BX63 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRIP1Q9BX63 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRIP1Q9BX63 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRIP1Q9BX63 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRIP1Q9BX63 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRIP1Q9BX63 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRIP1Q9BX63 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRIP1Q9BX63 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRIP1Q9BX63 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
BRIP1Q9BX63 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRIP1Q9BX63 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRIP1Q9BX63 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
BRIP1Q9BX63 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRIP1Q9BX63 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRIP1Q9BX63 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRIP1Q9BX63 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRIP1Q9BX63 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRIP1Q9BX63 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRIP1Q9BX63 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
BRIP1Q9BX63 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
BRIP1Q9BX63 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
BRIP1Q9BX63 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
BRIP1Q9BX63 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
BRIP1Q9BX63 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
BRIP1Q9BX63 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRIP1Q9BX63 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRIP1Q9BX63 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRIP1Q9BX63 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRIP1Q9BX63 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRIP1Q9BX63 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRIP1Q9BX63 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRIP1Q9BX63 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRIP1Q9BX63 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRIP1Q9BX63 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRIP1Q9BX63 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRIP1Q9BX63 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRIP1Q9BX63 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRIP1Q9BX63 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRIP1Q9BX63 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRIP1Q9BX63 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRIP1Q9BX63 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRIP1Q9BX63 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRIP1Q9BX63 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRIP1Q9BX63 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRIP1Q9BX63 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRIP1Q9BX63 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRIP1Q9BX63 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRIP1Q9BX63 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRIP1Q9BX63 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms