Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUI4

POLR3C, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3CQ9BUI4 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
POLR3CQ9BUI4 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLR3CQ9BUI4 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLR3CQ9BUI4 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLR3CQ9BUI4 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLR3CQ9BUI4 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLR3CQ9BUI4 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLR3CQ9BUI4 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLR3CQ9BUI4 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLR3CQ9BUI4 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLR3CQ9BUI4 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLR3CQ9BUI4 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLR3CQ9BUI4 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLR3CQ9BUI4 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLR3CQ9BUI4 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLR3CQ9BUI4 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
POLR3CQ9BUI4 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
POLR3CQ9BUI4 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLR3CQ9BUI4 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLR3CQ9BUI4 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLR3CQ9BUI4 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
POLR3CQ9BUI4 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLR3CQ9BUI4 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLR3CQ9BUI4 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLR3CQ9BUI4 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLR3CQ9BUI4 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLR3CQ9BUI4 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLR3CQ9BUI4 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLR3CQ9BUI4 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLR3CQ9BUI4 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLR3CQ9BUI4 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLR3CQ9BUI4 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLR3CQ9BUI4 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
POLR3CQ9BUI4 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
POLR3CQ9BUI4 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLR3CQ9BUI4 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLR3CQ9BUI4 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLR3CQ9BUI4 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLR3CQ9BUI4 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLR3CQ9BUI4 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
POLR3CQ9BUI4 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLR3CQ9BUI4 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLR3CQ9BUI4 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLR3CQ9BUI4 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLR3CQ9BUI4 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLR3CQ9BUI4 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLR3CQ9BUI4 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLR3CQ9BUI4 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLR3CQ9BUI4 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLR3CQ9BUI4 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
POLR3CQ9BUI4 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLR3CQ9BUI4 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLR3CQ9BUI4 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLR3CQ9BUI4 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
POLR3CQ9BUI4 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLR3CQ9BUI4 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLR3CQ9BUI4 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLR3CQ9BUI4 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
POLR3CQ9BUI4 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLR3CQ9BUI4 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLR3CQ9BUI4 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLR3CQ9BUI4 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLR3CQ9BUI4 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLR3CQ9BUI4 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLR3CQ9BUI4 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLR3CQ9BUI4 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLR3CQ9BUI4 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLR3CQ9BUI4 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLR3CQ9BUI4 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLR3CQ9BUI4 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLR3CQ9BUI4 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLR3CQ9BUI4 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLR3CQ9BUI4 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLR3CQ9BUI4 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLR3CQ9BUI4 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
POLR3CQ9BUI4 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLR3CQ9BUI4 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLR3CQ9BUI4 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLR3CQ9BUI4 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
POLR3CQ9BUI4 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLR3CQ9BUI4 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
POLR3CQ9BUI4 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
POLR3CQ9BUI4 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLR3CQ9BUI4 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLR3CQ9BUI4 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLR3CQ9BUI4 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLR3CQ9BUI4 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLR3CQ9BUI4 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLR3CQ9BUI4 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLR3CQ9BUI4 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLR3CQ9BUI4 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLR3CQ9BUI4 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLR3CQ9BUI4 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLR3CQ9BUI4 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLR3CQ9BUI4 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR3CQ9BUI4 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR3CQ9BUI4 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR3CQ9BUI4 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR3CQ9BUI4 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR3CQ9BUI4 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
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