Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU64

CENPO, Centromere protein O, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPOQ9BU64 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPOQ9BU64 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPOQ9BU64 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPOQ9BU64 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPOQ9BU64 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPOQ9BU64 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPOQ9BU64 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPOQ9BU64 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPOQ9BU64 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPOQ9BU64 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPOQ9BU64 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPOQ9BU64 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPOQ9BU64 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPOQ9BU64 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPOQ9BU64 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPOQ9BU64 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPOQ9BU64 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPOQ9BU64 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPOQ9BU64 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPOQ9BU64 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPOQ9BU64 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPOQ9BU64 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPOQ9BU64 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPOQ9BU64 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPOQ9BU64 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPOQ9BU64 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPOQ9BU64 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPOQ9BU64 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPOQ9BU64 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPOQ9BU64 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPOQ9BU64 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPOQ9BU64 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPOQ9BU64 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPOQ9BU64 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPOQ9BU64 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPOQ9BU64 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPOQ9BU64 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPOQ9BU64 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPOQ9BU64 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPOQ9BU64 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPOQ9BU64 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPOQ9BU64 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPOQ9BU64 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPOQ9BU64 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPOQ9BU64 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPOQ9BU64 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPOQ9BU64 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPOQ9BU64 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPOQ9BU64 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPOQ9BU64 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPOQ9BU64 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPOQ9BU64 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPOQ9BU64 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPOQ9BU64 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPOQ9BU64 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPOQ9BU64 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPOQ9BU64 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPOQ9BU64 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPOQ9BU64 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPOQ9BU64 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPOQ9BU64 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPOQ9BU64 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPOQ9BU64 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPOQ9BU64 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPOQ9BU64 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPOQ9BU64 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPOQ9BU64 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPOQ9BU64 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPOQ9BU64 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPOQ9BU64 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPOQ9BU64 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPOQ9BU64 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPOQ9BU64 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPOQ9BU64 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPOQ9BU64 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPOQ9BU64 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPOQ9BU64 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPOQ9BU64 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPOQ9BU64 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPOQ9BU64 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPOQ9BU64 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPOQ9BU64 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPOQ9BU64 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPOQ9BU64 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPOQ9BU64 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPOQ9BU64 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPOQ9BU64 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPOQ9BU64 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPOQ9BU64 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPOQ9BU64 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPOQ9BU64 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPOQ9BU64 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPOQ9BU64 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPOQ9BU64 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPOQ9BU64 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPOQ9BU64 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPOQ9BU64 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPOQ9BU64 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPOQ9BU64 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPOQ9BU64 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms