Protein–RNA interactions for Protein: Q99966

CITED1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1Q99966 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CITED1Q99966 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CITED1Q99966 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CITED1Q99966 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CITED1Q99966 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CITED1Q99966 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CITED1Q99966 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CITED1Q99966 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CITED1Q99966 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CITED1Q99966 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CITED1Q99966 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CITED1Q99966 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CITED1Q99966 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CITED1Q99966 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CITED1Q99966 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CITED1Q99966 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CITED1Q99966 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CITED1Q99966 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CITED1Q99966 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CITED1Q99966 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CITED1Q99966 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CITED1Q99966 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CITED1Q99966 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CITED1Q99966 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CITED1Q99966 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CITED1Q99966 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CITED1Q99966 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CITED1Q99966 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CITED1Q99966 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CITED1Q99966 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CITED1Q99966 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CITED1Q99966 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CITED1Q99966 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CITED1Q99966 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CITED1Q99966 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CITED1Q99966 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CITED1Q99966 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CITED1Q99966 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CITED1Q99966 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CITED1Q99966 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CITED1Q99966 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CITED1Q99966 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CITED1Q99966 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CITED1Q99966 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CITED1Q99966 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CITED1Q99966 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CITED1Q99966 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CITED1Q99966 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CITED1Q99966 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CITED1Q99966 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CITED1Q99966 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CITED1Q99966 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CITED1Q99966 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CITED1Q99966 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CITED1Q99966 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CITED1Q99966 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CITED1Q99966 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CITED1Q99966 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CITED1Q99966 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CITED1Q99966 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CITED1Q99966 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CITED1Q99966 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CITED1Q99966 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CITED1Q99966 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CITED1Q99966 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CITED1Q99966 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CITED1Q99966 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CITED1Q99966 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CITED1Q99966 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CITED1Q99966 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CITED1Q99966 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms