Protein–RNA interactions for Protein: Q99952

PTPN18, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 18, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN18Q99952 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPN18Q99952 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPN18Q99952 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPN18Q99952 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPN18Q99952 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPN18Q99952 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPN18Q99952 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPN18Q99952 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPN18Q99952 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPN18Q99952 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPN18Q99952 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPN18Q99952 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPN18Q99952 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPN18Q99952 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPN18Q99952 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPN18Q99952 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPN18Q99952 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPN18Q99952 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPN18Q99952 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPN18Q99952 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPN18Q99952 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPN18Q99952 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPN18Q99952 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN18Q99952 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN18Q99952 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN18Q99952 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN18Q99952 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN18Q99952 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN18Q99952 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN18Q99952 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN18Q99952 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN18Q99952 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN18Q99952 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN18Q99952 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN18Q99952 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN18Q99952 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN18Q99952 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN18Q99952 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN18Q99952 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN18Q99952 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN18Q99952 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN18Q99952 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN18Q99952 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN18Q99952 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN18Q99952 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN18Q99952 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN18Q99952 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN18Q99952 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN18Q99952 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN18Q99952 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN18Q99952 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN18Q99952 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN18Q99952 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN18Q99952 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN18Q99952 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN18Q99952 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN18Q99952 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN18Q99952 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN18Q99952 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN18Q99952 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN18Q99952 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN18Q99952 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN18Q99952 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN18Q99952 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN18Q99952 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPN18Q99952 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPN18Q99952 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPN18Q99952 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPN18Q99952 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPN18Q99952 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPN18Q99952 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPN18Q99952 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPN18Q99952 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPN18Q99952 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPN18Q99952 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPN18Q99952 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPN18Q99952 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPN18Q99952 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPN18Q99952 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPN18Q99952 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPN18Q99952 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPN18Q99952 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPN18Q99952 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPN18Q99952 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPN18Q99952 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPN18Q99952 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPN18Q99952 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPN18Q99952 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPN18Q99952 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPN18Q99952 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPN18Q99952 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPN18Q99952 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPN18Q99952 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPN18Q99952 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPN18Q99952 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPN18Q99952 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPN18Q99952 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPN18Q99952 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPN18Q99952 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPN18Q99952 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms