Protein–RNA interactions for Protein: Q96QT6

PHF12, PHD finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF12Q96QT6 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 AC113382.2-201ENST00000506911 646 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 SLC8A1-AS1-218ENST00000610721 956 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 AC092723.2-201ENST00000624955 793 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 TTTY14-204ENST00000452584 860 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 AL590133.2-202ENST00000561111 642 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 AC027701.1-202ENST00000520988 459 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 MYL10-201ENST00000223167 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 AL109620.1-201ENST00000618738 1197 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms