Protein–RNA interactions for Protein: Q96LX7

CCDC17, Coiled-coil domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC17Q96LX7 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC17Q96LX7 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC17Q96LX7 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC17Q96LX7 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC17Q96LX7 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC17Q96LX7 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC17Q96LX7 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC17Q96LX7 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC17Q96LX7 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC17Q96LX7 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC17Q96LX7 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC17Q96LX7 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC17Q96LX7 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC17Q96LX7 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC17Q96LX7 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC17Q96LX7 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC17Q96LX7 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC17Q96LX7 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC17Q96LX7 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC17Q96LX7 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC17Q96LX7 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC17Q96LX7 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC17Q96LX7 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC17Q96LX7 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC17Q96LX7 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC17Q96LX7 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC17Q96LX7 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC17Q96LX7 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC17Q96LX7 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC17Q96LX7 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC17Q96LX7 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC17Q96LX7 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC17Q96LX7 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC17Q96LX7 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC17Q96LX7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC17Q96LX7 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC17Q96LX7 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC17Q96LX7 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC17Q96LX7 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC17Q96LX7 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC17Q96LX7 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC17Q96LX7 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC17Q96LX7 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC17Q96LX7 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC17Q96LX7 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC17Q96LX7 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC17Q96LX7 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CCDC17Q96LX7 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC17Q96LX7 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC17Q96LX7 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC17Q96LX7 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC17Q96LX7 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC17Q96LX7 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC17Q96LX7 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC17Q96LX7 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC17Q96LX7 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC17Q96LX7 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC17Q96LX7 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC17Q96LX7 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC17Q96LX7 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC17Q96LX7 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC17Q96LX7 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC17Q96LX7 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC17Q96LX7 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC17Q96LX7 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC17Q96LX7 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC17Q96LX7 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC17Q96LX7 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC17Q96LX7 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC17Q96LX7 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC17Q96LX7 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC17Q96LX7 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC17Q96LX7 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC17Q96LX7 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC17Q96LX7 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC17Q96LX7 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC17Q96LX7 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC17Q96LX7 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC17Q96LX7 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC17Q96LX7 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC17Q96LX7 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC17Q96LX7 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC17Q96LX7 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC17Q96LX7 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC17Q96LX7 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC17Q96LX7 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC17Q96LX7 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC17Q96LX7 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC17Q96LX7 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC17Q96LX7 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC17Q96LX7 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC17Q96LX7 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC17Q96LX7 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC17Q96LX7 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC17Q96LX7 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC17Q96LX7 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC17Q96LX7 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC17Q96LX7 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC17Q96LX7 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC17Q96LX7 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms