Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD4

TRIM47, Tripartite motif-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM47Q96LD4 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM47Q96LD4 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM47Q96LD4 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM47Q96LD4 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM47Q96LD4 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM47Q96LD4 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM47Q96LD4 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM47Q96LD4 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM47Q96LD4 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM47Q96LD4 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM47Q96LD4 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM47Q96LD4 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM47Q96LD4 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM47Q96LD4 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM47Q96LD4 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM47Q96LD4 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM47Q96LD4 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM47Q96LD4 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM47Q96LD4 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM47Q96LD4 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM47Q96LD4 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM47Q96LD4 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM47Q96LD4 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM47Q96LD4 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM47Q96LD4 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM47Q96LD4 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM47Q96LD4 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM47Q96LD4 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM47Q96LD4 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM47Q96LD4 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM47Q96LD4 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM47Q96LD4 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM47Q96LD4 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM47Q96LD4 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM47Q96LD4 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM47Q96LD4 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM47Q96LD4 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM47Q96LD4 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM47Q96LD4 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM47Q96LD4 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM47Q96LD4 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM47Q96LD4 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM47Q96LD4 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM47Q96LD4 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM47Q96LD4 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM47Q96LD4 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM47Q96LD4 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM47Q96LD4 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM47Q96LD4 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM47Q96LD4 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM47Q96LD4 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM47Q96LD4 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM47Q96LD4 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM47Q96LD4 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM47Q96LD4 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM47Q96LD4 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM47Q96LD4 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM47Q96LD4 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM47Q96LD4 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM47Q96LD4 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM47Q96LD4 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM47Q96LD4 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM47Q96LD4 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM47Q96LD4 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM47Q96LD4 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM47Q96LD4 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM47Q96LD4 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM47Q96LD4 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM47Q96LD4 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM47Q96LD4 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM47Q96LD4 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM47Q96LD4 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM47Q96LD4 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM47Q96LD4 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM47Q96LD4 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM47Q96LD4 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM47Q96LD4 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM47Q96LD4 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM47Q96LD4 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM47Q96LD4 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM47Q96LD4 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM47Q96LD4 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM47Q96LD4 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM47Q96LD4 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM47Q96LD4 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM47Q96LD4 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM47Q96LD4 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM47Q96LD4 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM47Q96LD4 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM47Q96LD4 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM47Q96LD4 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM47Q96LD4 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM47Q96LD4 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM47Q96LD4 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM47Q96LD4 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM47Q96LD4 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM47Q96LD4 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM47Q96LD4 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM47Q96LD4 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM47Q96LD4 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms