Protein–RNA interactions for Protein: Q96JG6

VPS50, Syndetin, humanhuman

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS50Q96JG6 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
VPS50Q96JG6 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
VPS50Q96JG6 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VPS50Q96JG6 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VPS50Q96JG6 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VPS50Q96JG6 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VPS50Q96JG6 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VPS50Q96JG6 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VPS50Q96JG6 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
VPS50Q96JG6 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VPS50Q96JG6 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VPS50Q96JG6 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VPS50Q96JG6 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VPS50Q96JG6 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
VPS50Q96JG6 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VPS50Q96JG6 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
VPS50Q96JG6 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VPS50Q96JG6 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VPS50Q96JG6 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VPS50Q96JG6 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VPS50Q96JG6 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VPS50Q96JG6 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VPS50Q96JG6 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VPS50Q96JG6 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VPS50Q96JG6 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VPS50Q96JG6 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
VPS50Q96JG6 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VPS50Q96JG6 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VPS50Q96JG6 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VPS50Q96JG6 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VPS50Q96JG6 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VPS50Q96JG6 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VPS50Q96JG6 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VPS50Q96JG6 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VPS50Q96JG6 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC19■□□□□ 0.63
VPS50Q96JG6 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VPS50Q96JG6 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VPS50Q96JG6 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC19■□□□□ 0.63
VPS50Q96JG6 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
VPS50Q96JG6 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VPS50Q96JG6 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VPS50Q96JG6 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VPS50Q96JG6 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VPS50Q96JG6 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VPS50Q96JG6 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
VPS50Q96JG6 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
VPS50Q96JG6 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VPS50Q96JG6 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VPS50Q96JG6 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VPS50Q96JG6 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VPS50Q96JG6 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
VPS50Q96JG6 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VPS50Q96JG6 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VPS50Q96JG6 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VPS50Q96JG6 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VPS50Q96JG6 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms