Protein–RNA interactions for Protein: Q96F86

EDC3, Enhancer of mRNA-decapping protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC3Q96F86 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EDC3Q96F86 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EDC3Q96F86 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EDC3Q96F86 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
EDC3Q96F86 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EDC3Q96F86 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EDC3Q96F86 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EDC3Q96F86 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EDC3Q96F86 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EDC3Q96F86 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EDC3Q96F86 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EDC3Q96F86 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EDC3Q96F86 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EDC3Q96F86 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
EDC3Q96F86 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EDC3Q96F86 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EDC3Q96F86 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EDC3Q96F86 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EDC3Q96F86 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EDC3Q96F86 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EDC3Q96F86 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EDC3Q96F86 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EDC3Q96F86 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EDC3Q96F86 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EDC3Q96F86 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EDC3Q96F86 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EDC3Q96F86 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
EDC3Q96F86 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
EDC3Q96F86 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EDC3Q96F86 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EDC3Q96F86 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EDC3Q96F86 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EDC3Q96F86 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
EDC3Q96F86 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EDC3Q96F86 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EDC3Q96F86 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EDC3Q96F86 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EDC3Q96F86 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EDC3Q96F86 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EDC3Q96F86 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EDC3Q96F86 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EDC3Q96F86 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EDC3Q96F86 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
EDC3Q96F86 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EDC3Q96F86 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EDC3Q96F86 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EDC3Q96F86 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EDC3Q96F86 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EDC3Q96F86 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EDC3Q96F86 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EDC3Q96F86 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EDC3Q96F86 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EDC3Q96F86 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
EDC3Q96F86 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
EDC3Q96F86 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
EDC3Q96F86 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
EDC3Q96F86 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
EDC3Q96F86 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
EDC3Q96F86 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
EDC3Q96F86 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
EDC3Q96F86 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EDC3Q96F86 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EDC3Q96F86 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EDC3Q96F86 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EDC3Q96F86 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EDC3Q96F86 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EDC3Q96F86 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EDC3Q96F86 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EDC3Q96F86 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EDC3Q96F86 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EDC3Q96F86 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EDC3Q96F86 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EDC3Q96F86 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EDC3Q96F86 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EDC3Q96F86 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EDC3Q96F86 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EDC3Q96F86 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EDC3Q96F86 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EDC3Q96F86 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EDC3Q96F86 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EDC3Q96F86 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EDC3Q96F86 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EDC3Q96F86 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
EDC3Q96F86 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EDC3Q96F86 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EDC3Q96F86 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EDC3Q96F86 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EDC3Q96F86 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EDC3Q96F86 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EDC3Q96F86 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EDC3Q96F86 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EDC3Q96F86 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EDC3Q96F86 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EDC3Q96F86 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EDC3Q96F86 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EDC3Q96F86 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EDC3Q96F86 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EDC3Q96F86 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EDC3Q96F86 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EDC3Q96F86 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms