Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX7

TRIM44, Tripartite motif-containing protein 44, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM44Q96DX7 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM44Q96DX7 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM44Q96DX7 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM44Q96DX7 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM44Q96DX7 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM44Q96DX7 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM44Q96DX7 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM44Q96DX7 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM44Q96DX7 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM44Q96DX7 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM44Q96DX7 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM44Q96DX7 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM44Q96DX7 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM44Q96DX7 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM44Q96DX7 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM44Q96DX7 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM44Q96DX7 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM44Q96DX7 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM44Q96DX7 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM44Q96DX7 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM44Q96DX7 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM44Q96DX7 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM44Q96DX7 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM44Q96DX7 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM44Q96DX7 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM44Q96DX7 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM44Q96DX7 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM44Q96DX7 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM44Q96DX7 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM44Q96DX7 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM44Q96DX7 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM44Q96DX7 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM44Q96DX7 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM44Q96DX7 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM44Q96DX7 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM44Q96DX7 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM44Q96DX7 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM44Q96DX7 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM44Q96DX7 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM44Q96DX7 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM44Q96DX7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM44Q96DX7 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM44Q96DX7 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM44Q96DX7 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM44Q96DX7 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM44Q96DX7 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM44Q96DX7 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM44Q96DX7 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM44Q96DX7 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM44Q96DX7 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM44Q96DX7 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM44Q96DX7 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM44Q96DX7 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM44Q96DX7 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM44Q96DX7 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM44Q96DX7 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM44Q96DX7 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM44Q96DX7 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM44Q96DX7 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM44Q96DX7 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM44Q96DX7 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM44Q96DX7 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM44Q96DX7 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM44Q96DX7 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM44Q96DX7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM44Q96DX7 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM44Q96DX7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM44Q96DX7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM44Q96DX7 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM44Q96DX7 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM44Q96DX7 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM44Q96DX7 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM44Q96DX7 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM44Q96DX7 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM44Q96DX7 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM44Q96DX7 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM44Q96DX7 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM44Q96DX7 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM44Q96DX7 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM44Q96DX7 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM44Q96DX7 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM44Q96DX7 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM44Q96DX7 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM44Q96DX7 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM44Q96DX7 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM44Q96DX7 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM44Q96DX7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM44Q96DX7 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM44Q96DX7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM44Q96DX7 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM44Q96DX7 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM44Q96DX7 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM44Q96DX7 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM44Q96DX7 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM44Q96DX7 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM44Q96DX7 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRIM44Q96DX7 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRIM44Q96DX7 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRIM44Q96DX7 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM44Q96DX7 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms