Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC47Q96A33 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC47Q96A33 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC47Q96A33 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC47Q96A33 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC47Q96A33 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC47Q96A33 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC47Q96A33 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC47Q96A33 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC47Q96A33 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC47Q96A33 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC47Q96A33 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC47Q96A33 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC47Q96A33 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC47Q96A33 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC47Q96A33 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC47Q96A33 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC47Q96A33 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC47Q96A33 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC47Q96A33 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC47Q96A33 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC47Q96A33 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC47Q96A33 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC47Q96A33 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC47Q96A33 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC47Q96A33 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC47Q96A33 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC47Q96A33 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC47Q96A33 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC47Q96A33 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC47Q96A33 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC47Q96A33 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC47Q96A33 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC47Q96A33 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC47Q96A33 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC47Q96A33 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC47Q96A33 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC47Q96A33 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC47Q96A33 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC47Q96A33 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC47Q96A33 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC47Q96A33 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC47Q96A33 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC47Q96A33 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC47Q96A33 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC47Q96A33 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC47Q96A33 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC47Q96A33 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC47Q96A33 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC47Q96A33 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC47Q96A33 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC47Q96A33 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC47Q96A33 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC47Q96A33 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC47Q96A33 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC47Q96A33 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC47Q96A33 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC47Q96A33 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC47Q96A33 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC47Q96A33 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC47Q96A33 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC47Q96A33 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC47Q96A33 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC47Q96A33 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC47Q96A33 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC47Q96A33 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC47Q96A33 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC47Q96A33 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC47Q96A33 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC47Q96A33 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC47Q96A33 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC47Q96A33 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC47Q96A33 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC47Q96A33 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC47Q96A33 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC47Q96A33 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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