Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

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Length 353 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
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TRIM63Q969Q1 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM63Q969Q1 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM63Q969Q1 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM63Q969Q1 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM63Q969Q1 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM63Q969Q1 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
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TRIM63Q969Q1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
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TRIM63Q969Q1 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
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TRIM63Q969Q1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
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TRIM63Q969Q1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM63Q969Q1 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
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TRIM63Q969Q1 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM63Q969Q1 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM63Q969Q1 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM63Q969Q1 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM63Q969Q1 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM63Q969Q1 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
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TRIM63Q969Q1 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
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TRIM63Q969Q1 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
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TRIM63Q969Q1 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM63Q969Q1 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM63Q969Q1 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM63Q969Q1 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM63Q969Q1 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM63Q969Q1 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
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TRIM63Q969Q1 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
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TRIM63Q969Q1 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
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TRIM63Q969Q1 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM63Q969Q1 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
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TRIM63Q969Q1 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM63Q969Q1 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
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TRIM63Q969Q1 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
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TRIM63Q969Q1 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM63Q969Q1 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM63Q969Q1 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM63Q969Q1 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM63Q969Q1 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
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TRIM63Q969Q1 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM63Q969Q1 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM63Q969Q1 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM63Q969Q1 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM63Q969Q1 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM63Q969Q1 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM63Q969Q1 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM63Q969Q1 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM63Q969Q1 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM63Q969Q1 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM63Q969Q1 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM63Q969Q1 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM63Q969Q1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM63Q969Q1 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM63Q969Q1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM63Q969Q1 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
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