Protein–RNA interactions for Protein: Q969G9

NKD1, Protein naked cuticle homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD1Q969G9 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NKD1Q969G9 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms