Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HJURPQ8NCD3 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HJURPQ8NCD3 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HJURPQ8NCD3 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HJURPQ8NCD3 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HJURPQ8NCD3 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HJURPQ8NCD3 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HJURPQ8NCD3 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
HJURPQ8NCD3 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HJURPQ8NCD3 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HJURPQ8NCD3 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HJURPQ8NCD3 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HJURPQ8NCD3 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HJURPQ8NCD3 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HJURPQ8NCD3 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HJURPQ8NCD3 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HJURPQ8NCD3 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HJURPQ8NCD3 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HJURPQ8NCD3 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HJURPQ8NCD3 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HJURPQ8NCD3 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
HJURPQ8NCD3 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HJURPQ8NCD3 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HJURPQ8NCD3 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HJURPQ8NCD3 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HJURPQ8NCD3 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HJURPQ8NCD3 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HJURPQ8NCD3 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HJURPQ8NCD3 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HJURPQ8NCD3 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HJURPQ8NCD3 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HJURPQ8NCD3 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HJURPQ8NCD3 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HJURPQ8NCD3 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HJURPQ8NCD3 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HJURPQ8NCD3 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HJURPQ8NCD3 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HJURPQ8NCD3 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HJURPQ8NCD3 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HJURPQ8NCD3 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HJURPQ8NCD3 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HJURPQ8NCD3 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HJURPQ8NCD3 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HJURPQ8NCD3 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HJURPQ8NCD3 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HJURPQ8NCD3 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HJURPQ8NCD3 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HJURPQ8NCD3 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HJURPQ8NCD3 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HJURPQ8NCD3 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HJURPQ8NCD3 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HJURPQ8NCD3 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HJURPQ8NCD3 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HJURPQ8NCD3 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HJURPQ8NCD3 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HJURPQ8NCD3 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HJURPQ8NCD3 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HJURPQ8NCD3 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HJURPQ8NCD3 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HJURPQ8NCD3 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HJURPQ8NCD3 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
HJURPQ8NCD3 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HJURPQ8NCD3 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HJURPQ8NCD3 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HJURPQ8NCD3 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HJURPQ8NCD3 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HJURPQ8NCD3 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HJURPQ8NCD3 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HJURPQ8NCD3 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HJURPQ8NCD3 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HJURPQ8NCD3 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HJURPQ8NCD3 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HJURPQ8NCD3 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HJURPQ8NCD3 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HJURPQ8NCD3 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HJURPQ8NCD3 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HJURPQ8NCD3 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HJURPQ8NCD3 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HJURPQ8NCD3 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HJURPQ8NCD3 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HJURPQ8NCD3 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HJURPQ8NCD3 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HJURPQ8NCD3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HJURPQ8NCD3 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HJURPQ8NCD3 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HJURPQ8NCD3 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HJURPQ8NCD3 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HJURPQ8NCD3 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HJURPQ8NCD3 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
HJURPQ8NCD3 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HJURPQ8NCD3 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HJURPQ8NCD3 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HJURPQ8NCD3 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HJURPQ8NCD3 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HJURPQ8NCD3 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HJURPQ8NCD3 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HJURPQ8NCD3 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HJURPQ8NCD3 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HJURPQ8NCD3 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HJURPQ8NCD3 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms