Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB14

USP38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, humanhuman

Predictions only

Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP38Q8NB14 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP38Q8NB14 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP38Q8NB14 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP38Q8NB14 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP38Q8NB14 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP38Q8NB14 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP38Q8NB14 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP38Q8NB14 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP38Q8NB14 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP38Q8NB14 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
USP38Q8NB14 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP38Q8NB14 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP38Q8NB14 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP38Q8NB14 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP38Q8NB14 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP38Q8NB14 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP38Q8NB14 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP38Q8NB14 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP38Q8NB14 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP38Q8NB14 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP38Q8NB14 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP38Q8NB14 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP38Q8NB14 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP38Q8NB14 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP38Q8NB14 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP38Q8NB14 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP38Q8NB14 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP38Q8NB14 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP38Q8NB14 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP38Q8NB14 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP38Q8NB14 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP38Q8NB14 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP38Q8NB14 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP38Q8NB14 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP38Q8NB14 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP38Q8NB14 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP38Q8NB14 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP38Q8NB14 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
USP38Q8NB14 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP38Q8NB14 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP38Q8NB14 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP38Q8NB14 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP38Q8NB14 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP38Q8NB14 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP38Q8NB14 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP38Q8NB14 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP38Q8NB14 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP38Q8NB14 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP38Q8NB14 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP38Q8NB14 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP38Q8NB14 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP38Q8NB14 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP38Q8NB14 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP38Q8NB14 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
USP38Q8NB14 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP38Q8NB14 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP38Q8NB14 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP38Q8NB14 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP38Q8NB14 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP38Q8NB14 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP38Q8NB14 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
USP38Q8NB14 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP38Q8NB14 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP38Q8NB14 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP38Q8NB14 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP38Q8NB14 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP38Q8NB14 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP38Q8NB14 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP38Q8NB14 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP38Q8NB14 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP38Q8NB14 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP38Q8NB14 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP38Q8NB14 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP38Q8NB14 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
USP38Q8NB14 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP38Q8NB14 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP38Q8NB14 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP38Q8NB14 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP38Q8NB14 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP38Q8NB14 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP38Q8NB14 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP38Q8NB14 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP38Q8NB14 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP38Q8NB14 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP38Q8NB14 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP38Q8NB14 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP38Q8NB14 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP38Q8NB14 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP38Q8NB14 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP38Q8NB14 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP38Q8NB14 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
USP38Q8NB14 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP38Q8NB14 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
USP38Q8NB14 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP38Q8NB14 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP38Q8NB14 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP38Q8NB14 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP38Q8NB14 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
USP38Q8NB14 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP38Q8NB14 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
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