Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAT1

POMGNT2, Protein O-linked-mannose beta-1,4-N-acetylglucosaminyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMGNT2Q8NAT1 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POMGNT2Q8NAT1 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POMGNT2Q8NAT1 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POMGNT2Q8NAT1 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POMGNT2Q8NAT1 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POMGNT2Q8NAT1 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
POMGNT2Q8NAT1 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POMGNT2Q8NAT1 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POMGNT2Q8NAT1 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POMGNT2Q8NAT1 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POMGNT2Q8NAT1 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POMGNT2Q8NAT1 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POMGNT2Q8NAT1 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POMGNT2Q8NAT1 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POMGNT2Q8NAT1 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POMGNT2Q8NAT1 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POMGNT2Q8NAT1 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POMGNT2Q8NAT1 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POMGNT2Q8NAT1 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POMGNT2Q8NAT1 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POMGNT2Q8NAT1 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POMGNT2Q8NAT1 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POMGNT2Q8NAT1 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POMGNT2Q8NAT1 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POMGNT2Q8NAT1 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POMGNT2Q8NAT1 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
POMGNT2Q8NAT1 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
POMGNT2Q8NAT1 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POMGNT2Q8NAT1 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POMGNT2Q8NAT1 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POMGNT2Q8NAT1 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POMGNT2Q8NAT1 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POMGNT2Q8NAT1 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POMGNT2Q8NAT1 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POMGNT2Q8NAT1 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POMGNT2Q8NAT1 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POMGNT2Q8NAT1 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
POMGNT2Q8NAT1 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POMGNT2Q8NAT1 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POMGNT2Q8NAT1 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POMGNT2Q8NAT1 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POMGNT2Q8NAT1 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POMGNT2Q8NAT1 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POMGNT2Q8NAT1 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POMGNT2Q8NAT1 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POMGNT2Q8NAT1 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POMGNT2Q8NAT1 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POMGNT2Q8NAT1 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POMGNT2Q8NAT1 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POMGNT2Q8NAT1 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POMGNT2Q8NAT1 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POMGNT2Q8NAT1 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
POMGNT2Q8NAT1 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
POMGNT2Q8NAT1 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POMGNT2Q8NAT1 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POMGNT2Q8NAT1 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POMGNT2Q8NAT1 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POMGNT2Q8NAT1 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POMGNT2Q8NAT1 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POMGNT2Q8NAT1 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POMGNT2Q8NAT1 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POMGNT2Q8NAT1 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POMGNT2Q8NAT1 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POMGNT2Q8NAT1 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POMGNT2Q8NAT1 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POMGNT2Q8NAT1 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POMGNT2Q8NAT1 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POMGNT2Q8NAT1 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POMGNT2Q8NAT1 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POMGNT2Q8NAT1 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POMGNT2Q8NAT1 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POMGNT2Q8NAT1 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POMGNT2Q8NAT1 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
POMGNT2Q8NAT1 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
POMGNT2Q8NAT1 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
POMGNT2Q8NAT1 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POMGNT2Q8NAT1 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POMGNT2Q8NAT1 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POMGNT2Q8NAT1 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POMGNT2Q8NAT1 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POMGNT2Q8NAT1 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POMGNT2Q8NAT1 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POMGNT2Q8NAT1 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POMGNT2Q8NAT1 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
POMGNT2Q8NAT1 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POMGNT2Q8NAT1 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
POMGNT2Q8NAT1 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
POMGNT2Q8NAT1 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
POMGNT2Q8NAT1 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
POMGNT2Q8NAT1 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
POMGNT2Q8NAT1 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POMGNT2Q8NAT1 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POMGNT2Q8NAT1 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
POMGNT2Q8NAT1 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POMGNT2Q8NAT1 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
POMGNT2Q8NAT1 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POMGNT2Q8NAT1 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
POMGNT2Q8NAT1 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POMGNT2Q8NAT1 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POMGNT2Q8NAT1 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms