Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6C5

IGSF1, Immunoglobulin superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF1Q8N6C5 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
IGSF1Q8N6C5 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
IGSF1Q8N6C5 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
IGSF1Q8N6C5 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
IGSF1Q8N6C5 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
IGSF1Q8N6C5 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
IGSF1Q8N6C5 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
IGSF1Q8N6C5 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
IGSF1Q8N6C5 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
IGSF1Q8N6C5 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
IGSF1Q8N6C5 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
IGSF1Q8N6C5 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
IGSF1Q8N6C5 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
IGSF1Q8N6C5 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
IGSF1Q8N6C5 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
IGSF1Q8N6C5 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
IGSF1Q8N6C5 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
IGSF1Q8N6C5 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
IGSF1Q8N6C5 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
IGSF1Q8N6C5 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
IGSF1Q8N6C5 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
IGSF1Q8N6C5 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
IGSF1Q8N6C5 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
IGSF1Q8N6C5 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
IGSF1Q8N6C5 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
IGSF1Q8N6C5 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
IGSF1Q8N6C5 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
IGSF1Q8N6C5 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
IGSF1Q8N6C5 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
IGSF1Q8N6C5 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
IGSF1Q8N6C5 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
IGSF1Q8N6C5 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
IGSF1Q8N6C5 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
IGSF1Q8N6C5 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
IGSF1Q8N6C5 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
IGSF1Q8N6C5 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
IGSF1Q8N6C5 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
IGSF1Q8N6C5 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
IGSF1Q8N6C5 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
IGSF1Q8N6C5 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
IGSF1Q8N6C5 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
IGSF1Q8N6C5 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
IGSF1Q8N6C5 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
IGSF1Q8N6C5 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
IGSF1Q8N6C5 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
IGSF1Q8N6C5 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
IGSF1Q8N6C5 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
IGSF1Q8N6C5 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
IGSF1Q8N6C5 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
IGSF1Q8N6C5 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
IGSF1Q8N6C5 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
IGSF1Q8N6C5 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
IGSF1Q8N6C5 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
IGSF1Q8N6C5 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
IGSF1Q8N6C5 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
IGSF1Q8N6C5 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
IGSF1Q8N6C5 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
IGSF1Q8N6C5 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
IGSF1Q8N6C5 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
IGSF1Q8N6C5 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
IGSF1Q8N6C5 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
IGSF1Q8N6C5 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
IGSF1Q8N6C5 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
IGSF1Q8N6C5 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
IGSF1Q8N6C5 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
IGSF1Q8N6C5 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
IGSF1Q8N6C5 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
IGSF1Q8N6C5 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
IGSF1Q8N6C5 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
IGSF1Q8N6C5 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
IGSF1Q8N6C5 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
IGSF1Q8N6C5 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
IGSF1Q8N6C5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
IGSF1Q8N6C5 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
IGSF1Q8N6C5 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
IGSF1Q8N6C5 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
IGSF1Q8N6C5 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
IGSF1Q8N6C5 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
IGSF1Q8N6C5 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
IGSF1Q8N6C5 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
IGSF1Q8N6C5 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
IGSF1Q8N6C5 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
IGSF1Q8N6C5 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
IGSF1Q8N6C5 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
IGSF1Q8N6C5 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
IGSF1Q8N6C5 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
IGSF1Q8N6C5 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
IGSF1Q8N6C5 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
IGSF1Q8N6C5 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
IGSF1Q8N6C5 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
IGSF1Q8N6C5 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
IGSF1Q8N6C5 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
IGSF1Q8N6C5 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
IGSF1Q8N6C5 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
IGSF1Q8N6C5 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
IGSF1Q8N6C5 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
IGSF1Q8N6C5 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
IGSF1Q8N6C5 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
IGSF1Q8N6C5 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
IGSF1Q8N6C5 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms