Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1G4

LRRC47, Leucine-rich repeat-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC47Q8N1G4 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC47Q8N1G4 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC47Q8N1G4 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC47Q8N1G4 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC47Q8N1G4 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC47Q8N1G4 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC47Q8N1G4 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC47Q8N1G4 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC47Q8N1G4 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC47Q8N1G4 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC47Q8N1G4 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC47Q8N1G4 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC47Q8N1G4 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC47Q8N1G4 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC47Q8N1G4 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC47Q8N1G4 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC47Q8N1G4 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC47Q8N1G4 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC47Q8N1G4 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC47Q8N1G4 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC47Q8N1G4 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC47Q8N1G4 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC47Q8N1G4 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC47Q8N1G4 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC47Q8N1G4 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC47Q8N1G4 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC47Q8N1G4 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC47Q8N1G4 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC47Q8N1G4 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC47Q8N1G4 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC47Q8N1G4 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC47Q8N1G4 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC47Q8N1G4 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC47Q8N1G4 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC47Q8N1G4 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC47Q8N1G4 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC47Q8N1G4 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC47Q8N1G4 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC47Q8N1G4 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC47Q8N1G4 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC47Q8N1G4 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC47Q8N1G4 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC47Q8N1G4 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC47Q8N1G4 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC47Q8N1G4 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC47Q8N1G4 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC47Q8N1G4 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC47Q8N1G4 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC47Q8N1G4 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC47Q8N1G4 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC47Q8N1G4 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC47Q8N1G4 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC47Q8N1G4 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC47Q8N1G4 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC47Q8N1G4 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC47Q8N1G4 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC47Q8N1G4 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC47Q8N1G4 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC47Q8N1G4 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC47Q8N1G4 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC47Q8N1G4 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC47Q8N1G4 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC47Q8N1G4 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC47Q8N1G4 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC47Q8N1G4 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC47Q8N1G4 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC47Q8N1G4 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC47Q8N1G4 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC47Q8N1G4 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC47Q8N1G4 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC47Q8N1G4 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC47Q8N1G4 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC47Q8N1G4 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC47Q8N1G4 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC47Q8N1G4 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC47Q8N1G4 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC47Q8N1G4 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC47Q8N1G4 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC47Q8N1G4 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC47Q8N1G4 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC47Q8N1G4 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC47Q8N1G4 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC47Q8N1G4 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC47Q8N1G4 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC47Q8N1G4 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC47Q8N1G4 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC47Q8N1G4 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC47Q8N1G4 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC47Q8N1G4 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC47Q8N1G4 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC47Q8N1G4 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC47Q8N1G4 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC47Q8N1G4 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC47Q8N1G4 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC47Q8N1G4 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC47Q8N1G4 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC47Q8N1G4 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC47Q8N1G4 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC47Q8N1G4 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC47Q8N1G4 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms