Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVL0

NAV3, Neuron navigator 3, humanhuman

Predictions only

Length 2,385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAV3Q8IVL0 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NAV3Q8IVL0 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NAV3Q8IVL0 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NAV3Q8IVL0 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NAV3Q8IVL0 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NAV3Q8IVL0 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NAV3Q8IVL0 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NAV3Q8IVL0 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NAV3Q8IVL0 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NAV3Q8IVL0 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NAV3Q8IVL0 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NAV3Q8IVL0 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NAV3Q8IVL0 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NAV3Q8IVL0 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NAV3Q8IVL0 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NAV3Q8IVL0 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NAV3Q8IVL0 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NAV3Q8IVL0 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NAV3Q8IVL0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NAV3Q8IVL0 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NAV3Q8IVL0 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NAV3Q8IVL0 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NAV3Q8IVL0 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NAV3Q8IVL0 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NAV3Q8IVL0 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NAV3Q8IVL0 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NAV3Q8IVL0 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NAV3Q8IVL0 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NAV3Q8IVL0 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NAV3Q8IVL0 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NAV3Q8IVL0 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NAV3Q8IVL0 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NAV3Q8IVL0 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NAV3Q8IVL0 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NAV3Q8IVL0 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NAV3Q8IVL0 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NAV3Q8IVL0 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NAV3Q8IVL0 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NAV3Q8IVL0 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NAV3Q8IVL0 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NAV3Q8IVL0 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NAV3Q8IVL0 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NAV3Q8IVL0 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NAV3Q8IVL0 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NAV3Q8IVL0 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NAV3Q8IVL0 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NAV3Q8IVL0 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NAV3Q8IVL0 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NAV3Q8IVL0 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NAV3Q8IVL0 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NAV3Q8IVL0 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NAV3Q8IVL0 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NAV3Q8IVL0 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NAV3Q8IVL0 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NAV3Q8IVL0 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NAV3Q8IVL0 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NAV3Q8IVL0 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NAV3Q8IVL0 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NAV3Q8IVL0 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NAV3Q8IVL0 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NAV3Q8IVL0 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NAV3Q8IVL0 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NAV3Q8IVL0 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NAV3Q8IVL0 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NAV3Q8IVL0 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NAV3Q8IVL0 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NAV3Q8IVL0 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NAV3Q8IVL0 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NAV3Q8IVL0 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NAV3Q8IVL0 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NAV3Q8IVL0 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NAV3Q8IVL0 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NAV3Q8IVL0 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NAV3Q8IVL0 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NAV3Q8IVL0 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NAV3Q8IVL0 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NAV3Q8IVL0 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NAV3Q8IVL0 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NAV3Q8IVL0 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NAV3Q8IVL0 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NAV3Q8IVL0 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NAV3Q8IVL0 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NAV3Q8IVL0 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NAV3Q8IVL0 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NAV3Q8IVL0 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NAV3Q8IVL0 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NAV3Q8IVL0 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NAV3Q8IVL0 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NAV3Q8IVL0 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NAV3Q8IVL0 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NAV3Q8IVL0 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NAV3Q8IVL0 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
NAV3Q8IVL0 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
NAV3Q8IVL0 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NAV3Q8IVL0 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NAV3Q8IVL0 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NAV3Q8IVL0 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NAV3Q8IVL0 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NAV3Q8IVL0 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NAV3Q8IVL0 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms