Protein–RNA interactions for Protein: Q86TJ5

ZNF554, Zinc finger protein 554, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF554Q86TJ5 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF554Q86TJ5 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF554Q86TJ5 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF554Q86TJ5 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF554Q86TJ5 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF554Q86TJ5 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF554Q86TJ5 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF554Q86TJ5 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF554Q86TJ5 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF554Q86TJ5 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF554Q86TJ5 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF554Q86TJ5 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF554Q86TJ5 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF554Q86TJ5 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF554Q86TJ5 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF554Q86TJ5 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ZNF554Q86TJ5 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ZNF554Q86TJ5 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ZNF554Q86TJ5 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ZNF554Q86TJ5 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ZNF554Q86TJ5 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ZNF554Q86TJ5 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ZNF554Q86TJ5 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ZNF554Q86TJ5 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ZNF554Q86TJ5 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ZNF554Q86TJ5 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ZNF554Q86TJ5 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ZNF554Q86TJ5 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ZNF554Q86TJ5 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF554Q86TJ5 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF554Q86TJ5 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF554Q86TJ5 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF554Q86TJ5 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF554Q86TJ5 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF554Q86TJ5 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF554Q86TJ5 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF554Q86TJ5 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF554Q86TJ5 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF554Q86TJ5 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF554Q86TJ5 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF554Q86TJ5 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF554Q86TJ5 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF554Q86TJ5 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF554Q86TJ5 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF554Q86TJ5 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF554Q86TJ5 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF554Q86TJ5 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF554Q86TJ5 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF554Q86TJ5 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF554Q86TJ5 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF554Q86TJ5 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF554Q86TJ5 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF554Q86TJ5 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF554Q86TJ5 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF554Q86TJ5 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF554Q86TJ5 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF554Q86TJ5 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF554Q86TJ5 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF554Q86TJ5 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF554Q86TJ5 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF554Q86TJ5 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF554Q86TJ5 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF554Q86TJ5 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF554Q86TJ5 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF554Q86TJ5 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF554Q86TJ5 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF554Q86TJ5 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF554Q86TJ5 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF554Q86TJ5 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF554Q86TJ5 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF554Q86TJ5 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF554Q86TJ5 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF554Q86TJ5 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF554Q86TJ5 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF554Q86TJ5 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF554Q86TJ5 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF554Q86TJ5 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF554Q86TJ5 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF554Q86TJ5 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF554Q86TJ5 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF554Q86TJ5 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF554Q86TJ5 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF554Q86TJ5 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF554Q86TJ5 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF554Q86TJ5 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF554Q86TJ5 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF554Q86TJ5 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF554Q86TJ5 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF554Q86TJ5 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF554Q86TJ5 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF554Q86TJ5 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF554Q86TJ5 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNF554Q86TJ5 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNF554Q86TJ5 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNF554Q86TJ5 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNF554Q86TJ5 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNF554Q86TJ5 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNF554Q86TJ5 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNF554Q86TJ5 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNF554Q86TJ5 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms