Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTX7

CATSPER4, Cation channel sperm-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPER4Q7RTX7 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CATSPER4Q7RTX7 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CATSPER4Q7RTX7 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CATSPER4Q7RTX7 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CATSPER4Q7RTX7 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CATSPER4Q7RTX7 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CATSPER4Q7RTX7 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CATSPER4Q7RTX7 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CATSPER4Q7RTX7 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CATSPER4Q7RTX7 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CATSPER4Q7RTX7 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CATSPER4Q7RTX7 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CATSPER4Q7RTX7 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CATSPER4Q7RTX7 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CATSPER4Q7RTX7 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
CATSPER4Q7RTX7 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CATSPER4Q7RTX7 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CATSPER4Q7RTX7 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CATSPER4Q7RTX7 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CATSPER4Q7RTX7 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CATSPER4Q7RTX7 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CATSPER4Q7RTX7 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CATSPER4Q7RTX7 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CATSPER4Q7RTX7 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CATSPER4Q7RTX7 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CATSPER4Q7RTX7 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CATSPER4Q7RTX7 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CATSPER4Q7RTX7 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CATSPER4Q7RTX7 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CATSPER4Q7RTX7 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CATSPER4Q7RTX7 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CATSPER4Q7RTX7 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CATSPER4Q7RTX7 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CATSPER4Q7RTX7 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CATSPER4Q7RTX7 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CATSPER4Q7RTX7 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CATSPER4Q7RTX7 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CATSPER4Q7RTX7 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
CATSPER4Q7RTX7 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
CATSPER4Q7RTX7 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CATSPER4Q7RTX7 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CATSPER4Q7RTX7 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CATSPER4Q7RTX7 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CATSPER4Q7RTX7 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CATSPER4Q7RTX7 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CATSPER4Q7RTX7 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CATSPER4Q7RTX7 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CATSPER4Q7RTX7 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CATSPER4Q7RTX7 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CATSPER4Q7RTX7 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CATSPER4Q7RTX7 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CATSPER4Q7RTX7 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CATSPER4Q7RTX7 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CATSPER4Q7RTX7 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CATSPER4Q7RTX7 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CATSPER4Q7RTX7 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CATSPER4Q7RTX7 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CATSPER4Q7RTX7 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CATSPER4Q7RTX7 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CATSPER4Q7RTX7 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CATSPER4Q7RTX7 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CATSPER4Q7RTX7 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CATSPER4Q7RTX7 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CATSPER4Q7RTX7 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CATSPER4Q7RTX7 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CATSPER4Q7RTX7 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CATSPER4Q7RTX7 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CATSPER4Q7RTX7 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CATSPER4Q7RTX7 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CATSPER4Q7RTX7 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CATSPER4Q7RTX7 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CATSPER4Q7RTX7 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CATSPER4Q7RTX7 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CATSPER4Q7RTX7 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CATSPER4Q7RTX7 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CATSPER4Q7RTX7 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CATSPER4Q7RTX7 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CATSPER4Q7RTX7 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CATSPER4Q7RTX7 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CATSPER4Q7RTX7 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CATSPER4Q7RTX7 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CATSPER4Q7RTX7 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CATSPER4Q7RTX7 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CATSPER4Q7RTX7 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CATSPER4Q7RTX7 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CATSPER4Q7RTX7 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CATSPER4Q7RTX7 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CATSPER4Q7RTX7 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CATSPER4Q7RTX7 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CATSPER4Q7RTX7 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CATSPER4Q7RTX7 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CATSPER4Q7RTX7 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CATSPER4Q7RTX7 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CATSPER4Q7RTX7 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CATSPER4Q7RTX7 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CATSPER4Q7RTX7 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CATSPER4Q7RTX7 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CATSPER4Q7RTX7 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CATSPER4Q7RTX7 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CATSPER4Q7RTX7 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms