Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BHLHA9Q7RTU4 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BHLHA9Q7RTU4 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BHLHA9Q7RTU4 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BHLHA9Q7RTU4 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BHLHA9Q7RTU4 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
BHLHA9Q7RTU4 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BHLHA9Q7RTU4 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BHLHA9Q7RTU4 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BHLHA9Q7RTU4 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BHLHA9Q7RTU4 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BHLHA9Q7RTU4 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BHLHA9Q7RTU4 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BHLHA9Q7RTU4 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BHLHA9Q7RTU4 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BHLHA9Q7RTU4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BHLHA9Q7RTU4 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BHLHA9Q7RTU4 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BHLHA9Q7RTU4 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BHLHA9Q7RTU4 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BHLHA9Q7RTU4 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BHLHA9Q7RTU4 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BHLHA9Q7RTU4 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BHLHA9Q7RTU4 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BHLHA9Q7RTU4 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BHLHA9Q7RTU4 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BHLHA9Q7RTU4 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BHLHA9Q7RTU4 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BHLHA9Q7RTU4 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BHLHA9Q7RTU4 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
BHLHA9Q7RTU4 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
BHLHA9Q7RTU4 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
BHLHA9Q7RTU4 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
BHLHA9Q7RTU4 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
BHLHA9Q7RTU4 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BHLHA9Q7RTU4 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BHLHA9Q7RTU4 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BHLHA9Q7RTU4 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
BHLHA9Q7RTU4 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BHLHA9Q7RTU4 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BHLHA9Q7RTU4 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BHLHA9Q7RTU4 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BHLHA9Q7RTU4 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BHLHA9Q7RTU4 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BHLHA9Q7RTU4 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BHLHA9Q7RTU4 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BHLHA9Q7RTU4 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BHLHA9Q7RTU4 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BHLHA9Q7RTU4 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BHLHA9Q7RTU4 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
BHLHA9Q7RTU4 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BHLHA9Q7RTU4 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BHLHA9Q7RTU4 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BHLHA9Q7RTU4 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BHLHA9Q7RTU4 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BHLHA9Q7RTU4 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
BHLHA9Q7RTU4 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BHLHA9Q7RTU4 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BHLHA9Q7RTU4 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
BHLHA9Q7RTU4 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BHLHA9Q7RTU4 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BHLHA9Q7RTU4 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BHLHA9Q7RTU4 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BHLHA9Q7RTU4 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BHLHA9Q7RTU4 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BHLHA9Q7RTU4 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BHLHA9Q7RTU4 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BHLHA9Q7RTU4 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BHLHA9Q7RTU4 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BHLHA9Q7RTU4 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BHLHA9Q7RTU4 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BHLHA9Q7RTU4 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BHLHA9Q7RTU4 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BHLHA9Q7RTU4 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BHLHA9Q7RTU4 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BHLHA9Q7RTU4 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BHLHA9Q7RTU4 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BHLHA9Q7RTU4 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BHLHA9Q7RTU4 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
BHLHA9Q7RTU4 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
BHLHA9Q7RTU4 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BHLHA9Q7RTU4 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BHLHA9Q7RTU4 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BHLHA9Q7RTU4 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BHLHA9Q7RTU4 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BHLHA9Q7RTU4 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
BHLHA9Q7RTU4 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BHLHA9Q7RTU4 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BHLHA9Q7RTU4 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BHLHA9Q7RTU4 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BHLHA9Q7RTU4 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BHLHA9Q7RTU4 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BHLHA9Q7RTU4 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BHLHA9Q7RTU4 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BHLHA9Q7RTU4 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BHLHA9Q7RTU4 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BHLHA9Q7RTU4 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BHLHA9Q7RTU4 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BHLHA9Q7RTU4 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BHLHA9Q7RTU4 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms