Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT5

SSX7, Protein SSX7, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX7Q7RTT5 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSX7Q7RTT5 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms