Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RUFY3Q7L099 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RUFY3Q7L099 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RUFY3Q7L099 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RUFY3Q7L099 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RUFY3Q7L099 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RUFY3Q7L099 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RUFY3Q7L099 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RUFY3Q7L099 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RUFY3Q7L099 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RUFY3Q7L099 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RUFY3Q7L099 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RUFY3Q7L099 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RUFY3Q7L099 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RUFY3Q7L099 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RUFY3Q7L099 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RUFY3Q7L099 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RUFY3Q7L099 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RUFY3Q7L099 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RUFY3Q7L099 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RUFY3Q7L099 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RUFY3Q7L099 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RUFY3Q7L099 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RUFY3Q7L099 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RUFY3Q7L099 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RUFY3Q7L099 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RUFY3Q7L099 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RUFY3Q7L099 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RUFY3Q7L099 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RUFY3Q7L099 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RUFY3Q7L099 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RUFY3Q7L099 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RUFY3Q7L099 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RUFY3Q7L099 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RUFY3Q7L099 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RUFY3Q7L099 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RUFY3Q7L099 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RUFY3Q7L099 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RUFY3Q7L099 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RUFY3Q7L099 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RUFY3Q7L099 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RUFY3Q7L099 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RUFY3Q7L099 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RUFY3Q7L099 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RUFY3Q7L099 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RUFY3Q7L099 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RUFY3Q7L099 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RUFY3Q7L099 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RUFY3Q7L099 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RUFY3Q7L099 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RUFY3Q7L099 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RUFY3Q7L099 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RUFY3Q7L099 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RUFY3Q7L099 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RUFY3Q7L099 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RUFY3Q7L099 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RUFY3Q7L099 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RUFY3Q7L099 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RUFY3Q7L099 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RUFY3Q7L099 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RUFY3Q7L099 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RUFY3Q7L099 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RUFY3Q7L099 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RUFY3Q7L099 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RUFY3Q7L099 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RUFY3Q7L099 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RUFY3Q7L099 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RUFY3Q7L099 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RUFY3Q7L099 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RUFY3Q7L099 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RUFY3Q7L099 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RUFY3Q7L099 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RUFY3Q7L099 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RUFY3Q7L099 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RUFY3Q7L099 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RUFY3Q7L099 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RUFY3Q7L099 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RUFY3Q7L099 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RUFY3Q7L099 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RUFY3Q7L099 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RUFY3Q7L099 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RUFY3Q7L099 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RUFY3Q7L099 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RUFY3Q7L099 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RUFY3Q7L099 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RUFY3Q7L099 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RUFY3Q7L099 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RUFY3Q7L099 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RUFY3Q7L099 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RUFY3Q7L099 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RUFY3Q7L099 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RUFY3Q7L099 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RUFY3Q7L099 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RUFY3Q7L099 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RUFY3Q7L099 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RUFY3Q7L099 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RUFY3Q7L099 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RUFY3Q7L099 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RUFY3Q7L099 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RUFY3Q7L099 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms