Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC1

PP13850, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q71RC1 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q71RC1 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q71RC1 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q71RC1 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q71RC1 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Q71RC1 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q71RC1 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Q71RC1 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q71RC1 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q71RC1 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q71RC1 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q71RC1 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q71RC1 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Q71RC1 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Q71RC1 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q71RC1 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q71RC1 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q71RC1 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Q71RC1 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q71RC1 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q71RC1 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q71RC1 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q71RC1 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q71RC1 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q71RC1 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q71RC1 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q71RC1 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q71RC1 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q71RC1 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q71RC1 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q71RC1 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q71RC1 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q71RC1 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q71RC1 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q71RC1 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Q71RC1 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q71RC1 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q71RC1 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Q71RC1 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q71RC1 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Q71RC1 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Q71RC1 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Q71RC1 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q71RC1 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Q71RC1 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Q71RC1 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Q71RC1 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q71RC1 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q71RC1 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q71RC1 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q71RC1 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q71RC1 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q71RC1 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q71RC1 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q71RC1 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q71RC1 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q71RC1 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q71RC1 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q71RC1 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q71RC1 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q71RC1 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q71RC1 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q71RC1 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q71RC1 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q71RC1 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q71RC1 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q71RC1 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q71RC1 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q71RC1 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q71RC1 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q71RC1 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q71RC1 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q71RC1 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q71RC1 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q71RC1 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q71RC1 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q71RC1 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q71RC1 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q71RC1 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q71RC1 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q71RC1 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q71RC1 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q71RC1 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q71RC1 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Q71RC1 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q71RC1 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q71RC1 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q71RC1 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q71RC1 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q71RC1 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q71RC1 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q71RC1 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q71RC1 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q71RC1 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q71RC1 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q71RC1 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Q71RC1 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Q71RC1 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q71RC1 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q71RC1 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms