Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV77

C9orf139, Uncharacterized protein C9orf139, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf139Q6ZV77 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms