Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRZ4

C9orf47, Uncharacterized protein C9orf47, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf47Q6ZRZ4 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf47Q6ZRZ4 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf47Q6ZRZ4 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf47Q6ZRZ4 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf47Q6ZRZ4 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf47Q6ZRZ4 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf47Q6ZRZ4 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf47Q6ZRZ4 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf47Q6ZRZ4 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf47Q6ZRZ4 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf47Q6ZRZ4 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf47Q6ZRZ4 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf47Q6ZRZ4 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf47Q6ZRZ4 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf47Q6ZRZ4 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf47Q6ZRZ4 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf47Q6ZRZ4 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf47Q6ZRZ4 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf47Q6ZRZ4 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf47Q6ZRZ4 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf47Q6ZRZ4 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf47Q6ZRZ4 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf47Q6ZRZ4 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf47Q6ZRZ4 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf47Q6ZRZ4 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf47Q6ZRZ4 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf47Q6ZRZ4 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf47Q6ZRZ4 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf47Q6ZRZ4 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf47Q6ZRZ4 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf47Q6ZRZ4 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf47Q6ZRZ4 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf47Q6ZRZ4 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf47Q6ZRZ4 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf47Q6ZRZ4 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf47Q6ZRZ4 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf47Q6ZRZ4 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf47Q6ZRZ4 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf47Q6ZRZ4 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf47Q6ZRZ4 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf47Q6ZRZ4 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf47Q6ZRZ4 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf47Q6ZRZ4 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf47Q6ZRZ4 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf47Q6ZRZ4 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf47Q6ZRZ4 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf47Q6ZRZ4 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf47Q6ZRZ4 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf47Q6ZRZ4 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf47Q6ZRZ4 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf47Q6ZRZ4 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf47Q6ZRZ4 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf47Q6ZRZ4 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf47Q6ZRZ4 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf47Q6ZRZ4 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf47Q6ZRZ4 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf47Q6ZRZ4 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf47Q6ZRZ4 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf47Q6ZRZ4 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf47Q6ZRZ4 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf47Q6ZRZ4 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf47Q6ZRZ4 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf47Q6ZRZ4 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf47Q6ZRZ4 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf47Q6ZRZ4 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf47Q6ZRZ4 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf47Q6ZRZ4 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf47Q6ZRZ4 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf47Q6ZRZ4 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf47Q6ZRZ4 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf47Q6ZRZ4 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf47Q6ZRZ4 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf47Q6ZRZ4 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf47Q6ZRZ4 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf47Q6ZRZ4 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf47Q6ZRZ4 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf47Q6ZRZ4 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf47Q6ZRZ4 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf47Q6ZRZ4 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf47Q6ZRZ4 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf47Q6ZRZ4 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf47Q6ZRZ4 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf47Q6ZRZ4 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf47Q6ZRZ4 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf47Q6ZRZ4 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf47Q6ZRZ4 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf47Q6ZRZ4 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf47Q6ZRZ4 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf47Q6ZRZ4 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf47Q6ZRZ4 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf47Q6ZRZ4 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
C9orf47Q6ZRZ4 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
C9orf47Q6ZRZ4 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
C9orf47Q6ZRZ4 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
C9orf47Q6ZRZ4 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
C9orf47Q6ZRZ4 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
C9orf47Q6ZRZ4 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
C9orf47Q6ZRZ4 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
C9orf47Q6ZRZ4 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
C9orf47Q6ZRZ4 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms